87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0691 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  77.55 
 
 
97 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  79.45 
 
 
95 aa  121  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  61.22 
 
 
98 aa  120  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  56.57 
 
 
99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  68.49 
 
 
97 aa  108  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  57.28 
 
 
98 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  57.28 
 
 
98 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  56.86 
 
 
97 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.24 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.57 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.82 
 
 
99 aa  77  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.3 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.84 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.5 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.67 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.83 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.68 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.82 
 
 
102 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.43 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.7 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.63 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.63 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.86 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.84 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.35 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.67 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.07 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  39.02 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.69 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  33.66 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  35.44 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.71 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  34.74 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.96 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.78 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.11 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  34.78 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0037  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.65 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512398  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.35 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.99 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.86 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 
96 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 
110 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.73 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.26 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  28.87 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.91 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.22 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  34.33 
 
 
115 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.77 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.47 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  30.43 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.37 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2992  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.31 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.39 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.8 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2462  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00184271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0840  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.47 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1395  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.14 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00257587  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  33.77 
 
 
105 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2718  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.16 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2558  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00862222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.67 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  25 
 
 
121 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.99 
 
 
113 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0171  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 
101 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1358  flagellar hook-basal body protein FliE  33.78 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3956  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
111 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.72 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  31.82 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1765  flagellar hook-basal body protein FliE  32.05 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  23.91 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.94 
 
 
105 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1562  flagellar hook-basal body protein FliE  30.23 
 
 
99 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>