More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0159 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  69.09 
 
 
451 aa  667    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  68.87 
 
 
451 aa  663    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
453 aa  941    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  86.09 
 
 
453 aa  829    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  68.87 
 
 
451 aa  666    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  66.08 
 
 
457 aa  655    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  71.74 
 
 
453 aa  701    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  73.19 
 
 
452 aa  703    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  67.99 
 
 
451 aa  662    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  59.56 
 
 
455 aa  595  1e-169  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.34 
 
 
458 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.93 
 
 
462 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 
463 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  46.14 
 
 
482 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  45.7 
 
 
463 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  45.68 
 
 
463 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  45.7 
 
 
463 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 
463 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 
463 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  45.23 
 
 
461 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  45.11 
 
 
465 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.51 
 
 
478 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  45.85 
 
 
455 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  45.56 
 
 
464 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  45.56 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  45.37 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  43.39 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  45.56 
 
 
464 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 
464 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  44.29 
 
 
481 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  45.68 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.35 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  45.56 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  45.56 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  45.56 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 
457 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 
457 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 
483 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 
457 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 
481 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 
457 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 
481 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 
483 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 
483 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  45.47 
 
 
457 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 
457 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 
457 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  45.37 
 
 
500 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 
457 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 
470 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 
483 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  43.81 
 
 
460 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  43.81 
 
 
460 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  43.61 
 
 
483 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 
457 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  43.58 
 
 
460 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 
457 aa  388  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 
457 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 
463 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 
457 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  44.97 
 
 
463 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  44 
 
 
473 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  44.55 
 
 
472 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.61 
 
 
465 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 
457 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 
457 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 
457 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.67 
 
 
463 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.67 
 
 
463 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 
458 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  42.38 
 
 
456 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  43.99 
 
 
457 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  43.99 
 
 
457 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  43.99 
 
 
457 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 
462 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.07 
 
 
460 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  44.59 
 
 
485 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.11 
 
 
461 aa  382  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  41.7 
 
 
510 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 
456 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  44.42 
 
 
471 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  44.97 
 
 
463 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  44.52 
 
 
480 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  44.27 
 
 
457 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  42.05 
 
 
494 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  44.97 
 
 
446 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 
446 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  44.97 
 
 
446 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  43.01 
 
 
465 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 
446 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  44.74 
 
 
446 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 
458 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 
446 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  42.48 
 
 
460 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  45.06 
 
 
446 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 
446 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  42.3 
 
 
494 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 
465 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 
446 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>