129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07620 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  850    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  54.01 
 
 
414 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  45.37 
 
 
419 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  44.15 
 
 
419 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  45.23 
 
 
410 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  42.13 
 
 
419 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  39.29 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  40.83 
 
 
407 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  40.1 
 
 
402 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  38.69 
 
 
423 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  29.68 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  26.54 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 
902 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
456 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
956 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
994 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
1340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
703 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  22.65 
 
 
1119 aa  114  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
535 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.74 
 
 
860 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
499 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
1156 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
691 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
691 aa  87  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
683 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  26.19 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
691 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  21.51 
 
 
700 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  21.54 
 
 
1106 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  22.16 
 
 
537 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  23.79 
 
 
537 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  34.58 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
892 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  34.91 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
468 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  27.49 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
824 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  23.35 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  21.16 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  25.18 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  24.32 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  21.86 
 
 
410 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  24.4 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
391 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
387 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  26.5 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  26.36 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 
760 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  35.11 
 
 
354 aa  60.1  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  25.99 
 
 
408 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
399 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
399 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
400 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  21.38 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
429 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  21.03 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
405 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
421 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
1152 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
396 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  21.57 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  25.93 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
433 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  24.03 
 
 
413 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
406 aa  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  28.68 
 
 
402 aa  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  26.17 
 
 
673 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.169962 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>