More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1034 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 
257 aa  298  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.82 
 
 
254 aa  285  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6106  short chain enoyl-CoA hydratase  58.98 
 
 
256 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.03 
 
 
254 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 
265 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.82 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.78 
 
 
269 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.67 
 
 
260 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
260 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
258 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 
262 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.73 
 
 
260 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.73 
 
 
260 aa  201  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.14 
 
 
259 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
260 aa  201  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
259 aa  200  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 
260 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.68 
 
 
258 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.9 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  43.25 
 
 
257 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  43.5 
 
 
258 aa  194  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 
265 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.47 
 
 
258 aa  192  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  44.98 
 
 
259 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
266 aa  192  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
260 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  44.13 
 
 
257 aa  190  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 
260 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 
257 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.45 
 
 
260 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 
257 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  40.8 
 
 
283 aa  190  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 
257 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 
259 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.3 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.62 
 
 
258 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
260 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
257 aa  188  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
258 aa  188  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
257 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 
259 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
259 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.84 
 
 
260 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.2 
 
 
264 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
260 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
257 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.68 
 
 
265 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 
260 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 
257 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.48 
 
 
260 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
257 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 
268 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
260 aa  185  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.77 
 
 
258 aa  185  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 
257 aa  184  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.59 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  44.09 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
260 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.37 
 
 
257 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  41.02 
 
 
258 aa  181  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.46 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.43 
 
 
262 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
258 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.27 
 
 
259 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.92 
 
 
260 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.21 
 
 
260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  41.91 
 
 
258 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 
258 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.55 
 
 
260 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  41.91 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.55 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.71 
 
 
259 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  41.34 
 
 
259 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
263 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
257 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
258 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>