More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0213 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  100 
 
 
403 aa  826    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  40.25 
 
 
397 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  36.39 
 
 
395 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  39.03 
 
 
396 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  39.84 
 
 
402 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  36.73 
 
 
391 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  37.15 
 
 
377 aa  252  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  39.1 
 
 
387 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  39.64 
 
 
406 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  40.96 
 
 
385 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  38.48 
 
 
373 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  36.94 
 
 
421 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  39.88 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  39.2 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  40.85 
 
 
385 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  35.45 
 
 
385 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  40.37 
 
 
381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  40.37 
 
 
395 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 
420 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  41.33 
 
 
400 aa  230  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  39.43 
 
 
399 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  34.46 
 
 
397 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  34.46 
 
 
397 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  34.46 
 
 
397 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  34.46 
 
 
397 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  34.2 
 
 
397 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  38.64 
 
 
427 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  36.46 
 
 
391 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  36.46 
 
 
391 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  36.02 
 
 
390 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  35.67 
 
 
410 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  36.11 
 
 
400 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  38.75 
 
 
385 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  38.75 
 
 
385 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  35.2 
 
 
397 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  35.35 
 
 
412 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  38.04 
 
 
378 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  34 
 
 
404 aa  215  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  34.16 
 
 
422 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  33.93 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  38.18 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.92 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  36.88 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.91 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  34 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  37.65 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  37.09 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  37.65 
 
 
382 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  36.23 
 
 
402 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  37.35 
 
 
382 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  37.04 
 
 
385 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  40 
 
 
373 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  37.15 
 
 
382 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  35.8 
 
 
402 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  33.42 
 
 
404 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  35.8 
 
 
402 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  35.31 
 
 
397 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  36.14 
 
 
400 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  36.57 
 
 
389 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  33.51 
 
 
402 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  34.32 
 
 
396 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  36.65 
 
 
384 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  35.82 
 
 
404 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  35.28 
 
 
389 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  35.78 
 
 
402 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  34.96 
 
 
383 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  38.89 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  35.96 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  32.38 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  32.89 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  32.33 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  33.51 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  34.12 
 
 
400 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  33.33 
 
 
411 aa  201  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  35.5 
 
 
404 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  38.19 
 
 
398 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  36.51 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  38.9 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  34.02 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  32.81 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  36.36 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  36.78 
 
 
395 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  32.27 
 
 
447 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  35.98 
 
 
414 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  35.98 
 
 
414 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  36.87 
 
 
395 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  32.98 
 
 
421 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  35.36 
 
 
401 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  33.67 
 
 
384 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  34.05 
 
 
398 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  34.26 
 
 
384 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  34.62 
 
 
403 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  36.8 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  35.85 
 
 
444 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  33.67 
 
 
430 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  35.75 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  30.5 
 
 
427 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  36.34 
 
 
397 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  33.58 
 
 
399 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  35.04 
 
 
394 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>