35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2737 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 198 aa  406  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  78.17 
 
 		 198 aa  330  7.000000000000001e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  62.24 
 
 		 198 aa  245  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  55.85 
 
 		 203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  44.68 
 
 		 294 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  40.31 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  38.1 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  35.83 
 
 		 298 aa  101  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  34.83 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  38.25 
 
 		 261 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  32.54 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  33.16 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  38.18 
 
 		 303 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  38.18 
 
 		 299 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  35.5 
 
 		 238 aa  94.4  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  31.03 
 
 		 292 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  35.33 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  38.61 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  34.27 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  31.55 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  34.27 
 
 		 315 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  34.27 
 
 		 315 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  34.59 
 
 		 315 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  29.33 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  25.91 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  29.74 
 
 		 894 aa  55.5  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  28.41 
 
 		 392 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  28.91 
 
 		 377 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  29.69 
 
 		 375 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  26.99 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  32.38 
 
 		 377 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49621  predicted protein  27.2 
 
 		 311 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  26.99 
 
 		 294 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  26.38 
 
 		 288 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05310  hypothetical protein  28.57 
 
 		 912 aa  42  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>