37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6127 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6127  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 84 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0581987  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6138  PAAR repeat-containing protein  80.95 
 
 		 94 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  78.57 
 
 		 84 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  68.24 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  67.06 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  65.88 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  58.82 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  52.94 
 
 		 88 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  41.89 
 
 		 379 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  40.79 
 
 		 386 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  57.45 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  39.13 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  48.94 
 
 		 1422 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  42.11 
 
 		 1386 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  48.08 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 		 466 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  48.84 
 
 		 1229 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  40.74 
 
 		 592 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  44.64 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  44.64 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  44.64 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  41.51 
 
 		 1140 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  42.59 
 
 		 1411 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  40.51 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  44.23 
 
 		 855 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  40.38 
 
 		 1457 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  40.74 
 
 		 1409 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  47.5 
 
 		 1437 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  37.29 
 
 		 1446 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  41.18 
 
 		 1447 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  40.43 
 
 		 1428 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  41.3 
 
 		 540 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>