More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4454 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 209 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  87.86 
 
 		 212 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  87.19 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  87.19 
 
 		 242 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  86.47 
 
 		 209 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  87.19 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  85.71 
 
 		 210 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  87.19 
 
 		 236 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  86.89 
 
 		 212 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  86.89 
 
 		 211 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  85.65 
 
 		 209 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  87.19 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  87.19 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  85.17 
 
 		 209 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  86.41 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  86.89 
 
 		 211 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  87.19 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  87.31 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  78.39 
 
 		 211 aa  331  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  74.26 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  68.78 
 
 		 205 aa  304  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  72.87 
 
 		 212 aa  300  8.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  68.28 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  63.49 
 
 		 203 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  63.1 
 
 		 203 aa  263  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  63.04 
 
 		 190 aa  263  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  62.43 
 
 		 203 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  60.54 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  57 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  60.87 
 
 		 190 aa  254  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  57.79 
 
 		 269 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  59.89 
 
 		 219 aa  247  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  55.45 
 
 		 213 aa  246  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  58.92 
 
 		 219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  55.78 
 
 		 269 aa  244  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  55.78 
 
 		 269 aa  244  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  58.42 
 
 		 222 aa  244  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  56.28 
 
 		 201 aa  242  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  59.34 
 
 		 197 aa  241  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  58.79 
 
 		 206 aa  238  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  58.92 
 
 		 241 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 		 205 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  54.01 
 
 		 213 aa  234  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  57.75 
 
 		 204 aa  234  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 213 aa  234  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  54.45 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  53.48 
 
 		 213 aa  232  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  56.08 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  53.51 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  56.91 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  55.14 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  58.24 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  54.97 
 
 		 229 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  55.5 
 
 		 229 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  58.01 
 
 		 192 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  55.03 
 
 		 234 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  54.4 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  52.2 
 
 		 206 aa  221  7e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  51.08 
 
 		 195 aa  205  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  50.8 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  50.82 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  47.57 
 
 		 190 aa  196  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  48.66 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  47.06 
 
 		 235 aa  194  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  47.87 
 
 		 190 aa  194  7e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  46.6 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 226 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  47.87 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  52.57 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  47.54 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  52.57 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  48.45 
 
 		 213 aa  191  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  47.62 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  49.45 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  46.49 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  49.5 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  47.34 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  46.88 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  44.22 
 
 		 243 aa  188  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>