More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1481 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  87.37 
 
 		 190 aa  345  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  86.84 
 
 		 190 aa  343  7e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  86.32 
 
 		 190 aa  342  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  75.26 
 
 		 190 aa  311  4.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  74.21 
 
 		 190 aa  307  8e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  73.26 
 
 		 195 aa  303  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  69.31 
 
 		 193 aa  286  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  69.52 
 
 		 194 aa  280  1e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  70.95 
 
 		 179 aa  272  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  62.86 
 
 		 216 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  59.22 
 
 		 219 aa  238  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 		 226 aa  237  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  61.14 
 
 		 218 aa  237  8e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  60.22 
 
 		 247 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  61.2 
 
 		 220 aa  234  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  60.45 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  59.32 
 
 		 223 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  59.67 
 
 		 239 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  59.67 
 
 		 239 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 		 198 aa  230  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  57.3 
 
 		 199 aa  230  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  57.07 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 187 aa  228  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 		 213 aa  228  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 		 187 aa  227  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  57.46 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  60.57 
 
 		 235 aa  226  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  57.53 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 		 186 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 		 186 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  57.46 
 
 		 214 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  57.46 
 
 		 214 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  56.83 
 
 		 186 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  59.12 
 
 		 226 aa  223  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 		 235 aa  223  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  59.66 
 
 		 218 aa  222  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  56.83 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  59.09 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 186 aa  221  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 		 186 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  56.9 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  55.37 
 
 		 189 aa  218  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 		 181 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  57.87 
 
 		 181 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  56.82 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 		 184 aa  218  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 		 181 aa  217  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 181 aa  217  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  55.8 
 
 		 235 aa  217  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  54.4 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 		 181 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  55 
 
 		 243 aa  214  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 		 181 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  57.99 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  52.75 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  52.75 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  53.14 
 
 		 186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  56.5 
 
 		 195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  53.71 
 
 		 210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  52.75 
 
 		 270 aa  207  5e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  50.27 
 
 		 435 aa  207  6e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  55.25 
 
 		 200 aa  207  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  55.25 
 
 		 189 aa  205  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 		 182 aa  204  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  52 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 		 189 aa  201  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  49.44 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  50.82 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 181 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 190 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  54.4 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 188 aa  197  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 		 188 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  49.17 
 
 		 329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  49.17 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  50.82 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  52.46 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>