More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0582 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  81.41 
 
 		 204 aa  333  9e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  83.61 
 
 		 197 aa  327  8e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  75 
 
 		 200 aa  316  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  78.95 
 
 		 211 aa  315  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  77.25 
 
 		 192 aa  304  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  62.05 
 
 		 205 aa  251  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  64.64 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  60.99 
 
 		 206 aa  242  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  64.41 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  60.99 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  54.12 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  63.13 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  54.87 
 
 		 203 aa  238  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  58.79 
 
 		 209 aa  238  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 		 211 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  54.36 
 
 		 203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  57.14 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  55.74 
 
 		 190 aa  231  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 		 210 aa  231  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 		 236 aa  230  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 		 292 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 		 292 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 		 258 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 		 292 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 		 292 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 		 292 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  52.79 
 
 		 222 aa  225  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  56.25 
 
 		 222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  52.79 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  55.25 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 205 aa  207  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  53.04 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  55.88 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  54.3 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  48.51 
 
 		 213 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 		 241 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  50.79 
 
 		 242 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  49.44 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  57.42 
 
 		 204 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  48.35 
 
 		 188 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 		 190 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  56.13 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  45.58 
 
 		 227 aa  191  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  52.63 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  45.89 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  48.96 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  51.69 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 212 aa  187  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  48.94 
 
 		 243 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  48.35 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  48.9 
 
 		 235 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  48.35 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 		 216 aa  185  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  46.57 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  48.62 
 
 		 188 aa  184  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  48.9 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  47.8 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  48.31 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  47.64 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  48.07 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  48.62 
 
 		 192 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  47.22 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  48.33 
 
 		 188 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  47.25 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>