More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1849 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
204 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  96.08 
 
 
204 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  79.31 
 
 
205 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  70.97 
 
 
222 aa  318  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  69.54 
 
 
213 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  69.54 
 
 
213 aa  295  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  70.24 
 
 
201 aa  288  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  59.63 
 
 
219 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  59.17 
 
 
219 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  69.89 
 
 
213 aa  267  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  62.81 
 
 
242 aa  267  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  64.36 
 
 
269 aa  267  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  65.43 
 
 
269 aa  266  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  65.43 
 
 
269 aa  266  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  63.59 
 
 
206 aa  266  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  60.95 
 
 
213 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  64.92 
 
 
229 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  64.4 
 
 
229 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  63.68 
 
 
272 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  63.35 
 
 
229 aa  260  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  60.89 
 
 
234 aa  259  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  62.05 
 
 
241 aa  259  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  61.58 
 
 
234 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  62.11 
 
 
232 aa  254  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 
209 aa  248  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 
209 aa  245  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  58.51 
 
 
222 aa  244  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  57.22 
 
 
212 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 
212 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
292 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
292 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
242 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
292 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
292 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
236 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
292 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  56.15 
 
 
209 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 
209 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  56.15 
 
 
211 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  56.15 
 
 
211 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  56.45 
 
 
258 aa  241  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 
211 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  58.29 
 
 
234 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  57.84 
 
 
205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 
211 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  58.51 
 
 
213 aa  234  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  55.74 
 
 
203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
205 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  55.74 
 
 
203 aa  231  6e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  54.12 
 
 
212 aa  229  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 
206 aa  228  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  54.21 
 
 
206 aa  228  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 
190 aa  223  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  51.87 
 
 
190 aa  219  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 
203 aa  218  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  52.2 
 
 
226 aa  218  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  56.22 
 
 
210 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  53.4 
 
 
219 aa  211  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  51.52 
 
 
214 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  51.52 
 
 
214 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  52.6 
 
 
219 aa  207  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  50.83 
 
 
197 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  51.81 
 
 
223 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 
223 aa  205  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 
201 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 
201 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 
201 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  54.79 
 
 
216 aa  204  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  50.77 
 
 
213 aa  204  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  54.89 
 
 
202 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  55.69 
 
 
192 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 
212 aa  202  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  54.89 
 
 
202 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  51.72 
 
 
206 aa  201  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  51.05 
 
 
235 aa  201  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 
187 aa  201  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  52.94 
 
 
204 aa  201  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 
218 aa  201  7e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  51.35 
 
 
239 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  51.35 
 
 
239 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  51.28 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  49.72 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  52.46 
 
 
225 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  53.26 
 
 
219 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 
247 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 
235 aa  198  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  54.01 
 
 
202 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 
226 aa  197  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 
216 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  48.5 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  55.8 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  48.89 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  50.51 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 
209 aa  195  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  53.63 
 
 
187 aa  195  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>