More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2540 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  95.54 
 
 		 269 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  77.12 
 
 		 272 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 		 219 aa  331  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  68.15 
 
 		 219 aa  331  9e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  70.47 
 
 		 213 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  71.58 
 
 		 213 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  57.09 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  61.57 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  67.02 
 
 		 201 aa  268  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  65.24 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  65.24 
 
 		 213 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  66.84 
 
 		 205 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  66.31 
 
 		 213 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  56.65 
 
 		 206 aa  255  7e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  61.29 
 
 		 222 aa  251  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  65.96 
 
 		 204 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 		 212 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  65.43 
 
 		 204 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  51.21 
 
 		 241 aa  246  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  58.42 
 
 		 212 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  55.78 
 
 		 209 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  58.82 
 
 		 212 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  58.03 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  59.34 
 
 		 205 aa  242  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  53.54 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  60.43 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  57.81 
 
 		 210 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  60.75 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 211 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 211 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  58.51 
 
 		 229 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  56.38 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  56.38 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  56.25 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  56.38 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  56.7 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  56.38 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  59.67 
 
 		 205 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  56.38 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  56.38 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  56.08 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  56.38 
 
 		 236 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  56.19 
 
 		 209 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  61.62 
 
 		 213 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 		 229 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  53.72 
 
 		 211 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  54.5 
 
 		 190 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 		 203 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 203 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 190 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  48.99 
 
 		 206 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 197 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  44.64 
 
 		 235 aa  205  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  44.59 
 
 		 235 aa  203  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 189 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  51.93 
 
 		 206 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  51.87 
 
 		 213 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  47.59 
 
 		 188 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  49.48 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  42.68 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  42.68 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  51.67 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  52.22 
 
 		 188 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  48.48 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  48.48 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  54.12 
 
 		 192 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  52.49 
 
 		 210 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  48.74 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  47.59 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  48.13 
 
 		 247 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  55.88 
 
 		 202 aa  191  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  48.66 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  47.42 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 		 198 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  47.42 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  50.84 
 
 		 188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  50.79 
 
 		 202 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 202 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 188 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 		 218 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  46.34 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 		 189 aa  188  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>