More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1576 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 213 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  75.12 
 
 		 213 aa  340  7e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  70.47 
 
 		 269 aa  295  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  70.47 
 
 		 269 aa  294  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  70.47 
 
 		 269 aa  294  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  63.18 
 
 		 219 aa  287  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  62.27 
 
 		 219 aa  284  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  60.81 
 
 		 222 aa  278  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  67.72 
 
 		 272 aa  277  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  68.09 
 
 		 242 aa  275  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 232 aa  261  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  61.98 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  64.58 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  60.85 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  60.41 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  61.46 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  61.66 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  59.39 
 
 		 234 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  59.39 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  61.43 
 
 		 204 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  60.11 
 
 		 213 aa  247  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  55.45 
 
 		 209 aa  246  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  59.57 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  56.85 
 
 		 212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  57.75 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  57.67 
 
 		 212 aa  241  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  54.5 
 
 		 209 aa  240  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  53.66 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  56.92 
 
 		 236 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  56.92 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  56.92 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  56.92 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  56.92 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  56.92 
 
 		 242 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  56.92 
 
 		 292 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  57.07 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  56.54 
 
 		 212 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  55.1 
 
 		 211 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 		 205 aa  238  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  55.1 
 
 		 211 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  54.08 
 
 		 209 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  55.84 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  54.23 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  58.51 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 		 206 aa  227  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  54.84 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  52.04 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  49.47 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  51.85 
 
 		 190 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  47.4 
 
 		 203 aa  208  6e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  46.35 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 		 197 aa  201  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  48.07 
 
 		 203 aa  198  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  46.74 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  48.13 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 		 202 aa  194  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  48.08 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  49.72 
 
 		 211 aa  194  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  56.8 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  51.32 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  50.57 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  52.72 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  52.63 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 189 aa  191  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 200 aa  191  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 206 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  49.17 
 
 		 192 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 202 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  55.03 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  48.44 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  48.19 
 
 		 209 aa  188  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 198 aa  188  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 190 aa  187  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  54.97 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  44.65 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  47.57 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  51.98 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  48.39 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>