More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1049 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  80.3 
 
 		 204 aa  328  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  79.31 
 
 		 204 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  66.36 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  70.44 
 
 		 201 aa  293  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  72.58 
 
 		 213 aa  291  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  72.58 
 
 		 213 aa  290  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  62.96 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  62.5 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  65.24 
 
 		 213 aa  274  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  65.66 
 
 		 242 aa  274  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  67.72 
 
 		 272 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  66.84 
 
 		 269 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  71.66 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  60.85 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  66.84 
 
 		 269 aa  269  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  66.84 
 
 		 269 aa  269  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  60.54 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  64.71 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  63.83 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  63.64 
 
 		 241 aa  252  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  63.64 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  63.98 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  63.1 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  62.9 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  55.5 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  57.95 
 
 		 212 aa  238  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  56.32 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  57.84 
 
 		 209 aa  237  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 234 aa  235  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 236 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 		 210 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 292 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 292 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 222 aa  234  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 242 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 292 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  54.97 
 
 		 212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 292 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  57.53 
 
 		 211 aa  234  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 		 258 aa  234  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 292 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  55.08 
 
 		 211 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  56.15 
 
 		 205 aa  231  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  56.84 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  57.38 
 
 		 203 aa  228  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  56.28 
 
 		 203 aa  224  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  51.72 
 
 		 206 aa  224  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 		 205 aa  224  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  51.43 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 		 190 aa  218  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  53.48 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  52.94 
 
 		 203 aa  214  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  54.35 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  56.9 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  56.52 
 
 		 201 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  56.52 
 
 		 201 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  56.52 
 
 		 201 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  55.26 
 
 		 202 aa  201  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  50 
 
 		 204 aa  201  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  51.93 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  53.85 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  56.83 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  57.67 
 
 		 200 aa  197  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  50.54 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 		 202 aa  197  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  59.3 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  51.11 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  47.06 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  49.19 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  48.48 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  48.48 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 222 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  54.89 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  52.33 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  49.5 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  47.62 
 
 		 235 aa  191  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  51.34 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  53.25 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  49.22 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  50 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  50.56 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  51.04 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  46.15 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  50.84 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 		 220 aa  188  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  53.99 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  50.83 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>