More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5116 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  99.53 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  96.68 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  96.15 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  95.67 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  95.19 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  95.96 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  95.96 
 
 		 242 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  95.96 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  95.96 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  95.96 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  95.96 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  95.96 
 
 		 236 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  94.92 
 
 		 258 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  86.89 
 
 		 209 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  85.92 
 
 		 212 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  85.92 
 
 		 212 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  77.16 
 
 		 211 aa  321  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  70.73 
 
 		 206 aa  315  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  72.22 
 
 		 205 aa  306  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  72.58 
 
 		 212 aa  295  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  68.09 
 
 		 234 aa  288  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  65.03 
 
 		 190 aa  266  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  61.5 
 
 		 203 aa  264  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  62.43 
 
 		 203 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  62.43 
 
 		 203 aa  260  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  61.08 
 
 		 190 aa  254  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  57.79 
 
 		 206 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  59.79 
 
 		 269 aa  246  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  57.5 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 		 222 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  57.07 
 
 		 201 aa  242  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  56.19 
 
 		 219 aa  240  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  56.41 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  55.32 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 269 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 269 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  55.1 
 
 		 213 aa  238  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  57.53 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  61.11 
 
 		 210 aa  235  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  56.59 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  55.68 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 		 205 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  58.01 
 
 		 192 aa  231  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  56.32 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 200 aa  229  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  55.8 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  56.15 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 		 234 aa  225  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  53.44 
 
 		 242 aa  224  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 		 213 aa  224  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  51.6 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  54.79 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  53.16 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  52.6 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  53.16 
 
 		 234 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  52.63 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 195 aa  197  7.999999999999999e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  47.72 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  46 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  46 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  52.54 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  45.79 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  52.54 
 
 		 184 aa  194  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  45.5 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  47.42 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 193 aa  193  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  46.77 
 
 		 235 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 		 190 aa  191  9e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  50.83 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  48.3 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  46.77 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  44.21 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  50.54 
 
 		 216 aa  188  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  51.05 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 		 200 aa  187  9e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  46.74 
 
 		 190 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>