More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0356 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 213 aa  434  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  75.12 
 
 		 213 aa  340  7e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  72.63 
 
 		 269 aa  294  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  71.58 
 
 		 269 aa  290  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  71.58 
 
 		 269 aa  290  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  66.82 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  71.58 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  72.73 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  66.51 
 
 		 219 aa  285  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  62.1 
 
 		 222 aa  274  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  67.36 
 
 		 232 aa  266  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  64.25 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  65.61 
 
 		 234 aa  264  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  63.27 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  65.24 
 
 		 205 aa  261  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  62.76 
 
 		 213 aa  258  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  65.08 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  64.55 
 
 		 229 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  65.48 
 
 		 213 aa  255  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  62.24 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  59.72 
 
 		 201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  63.21 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  54.29 
 
 		 222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  62.38 
 
 		 204 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 206 aa  246  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  60.95 
 
 		 204 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  58.21 
 
 		 212 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  60.75 
 
 		 213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  56.28 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  52.83 
 
 		 205 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  54.73 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  56.78 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 		 292 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 		 292 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 		 292 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 		 292 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 		 292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 209 aa  234  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 		 242 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 258 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  55.28 
 
 		 209 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 		 205 aa  231  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  56.15 
 
 		 211 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  59.04 
 
 		 190 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  52.08 
 
 		 203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  50.74 
 
 		 203 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  51.56 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 197 aa  211  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  52.85 
 
 		 204 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  52.41 
 
 		 190 aa  205  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  50.48 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  54.59 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  50 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  53.26 
 
 		 211 aa  201  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  51.06 
 
 		 187 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  55.44 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  54.7 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  55.74 
 
 		 195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  54.89 
 
 		 214 aa  197  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  55.74 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  54.95 
 
 		 193 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  54.84 
 
 		 194 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  54.24 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  54.14 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  50.25 
 
 		 199 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 187 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 205 aa  191  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  53.68 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  53.59 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>