More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4310 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
212 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  97.17 
 
 
212 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  87.86 
 
 
209 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  82.19 
 
 
292 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  82.19 
 
 
242 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  82.19 
 
 
292 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  86.06 
 
 
210 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  82.19 
 
 
292 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  82.19 
 
 
292 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  82.19 
 
 
236 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  85.44 
 
 
211 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  85.1 
 
 
209 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  85.92 
 
 
211 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  85.92 
 
 
209 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  85.44 
 
 
209 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  85.92 
 
 
211 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  82.11 
 
 
292 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  86.8 
 
 
258 aa  363  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  76.88 
 
 
211 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  72.68 
 
 
206 aa  320  8e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  73.94 
 
 
205 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  70.9 
 
 
234 aa  296  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  73.51 
 
 
212 aa  296  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
190 aa  264  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  63.39 
 
 
203 aa  263  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  63.04 
 
 
190 aa  261  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
203 aa  260  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  61.75 
 
 
203 aa  255  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  58.42 
 
 
222 aa  254  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 
269 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  56.78 
 
 
219 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  58.33 
 
 
219 aa  248  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  56.28 
 
 
206 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  58.42 
 
 
269 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  58.42 
 
 
269 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  58.85 
 
 
222 aa  244  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  59.34 
 
 
197 aa  244  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  56.85 
 
 
213 aa  242  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 
205 aa  242  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  57.75 
 
 
272 aa  241  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  55.84 
 
 
201 aa  238  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  56.28 
 
 
213 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  58.42 
 
 
241 aa  235  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  55.32 
 
 
242 aa  234  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 
232 aa  234  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  60.56 
 
 
210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  57.14 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  55.91 
 
 
213 aa  231  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 
213 aa  230  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
234 aa  229  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
229 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  55.14 
 
 
204 aa  228  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  52.69 
 
 
213 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 
205 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  57.46 
 
 
192 aa  226  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 
204 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 
204 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  53.97 
 
 
229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  55.8 
 
 
211 aa  225  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  56.5 
 
 
200 aa  224  8e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  53.26 
 
 
213 aa  223  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 
234 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  52.91 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 
206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 
225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 
226 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 
190 aa  195  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  47.31 
 
 
195 aa  192  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  46.32 
 
 
247 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  48.13 
 
 
213 aa  192  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  51.4 
 
 
224 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 
190 aa  192  4e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
205 aa  191  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  49.45 
 
 
223 aa  191  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 
189 aa  191  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  47.12 
 
 
214 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 
226 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  48.11 
 
 
193 aa  190  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  47.12 
 
 
214 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  48.26 
 
 
220 aa  190  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  52.6 
 
 
186 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  46.52 
 
 
194 aa  190  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  48.15 
 
 
270 aa  189  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 
188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  47.73 
 
 
179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  51.56 
 
 
198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 
213 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  46.8 
 
 
216 aa  188  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 
216 aa  188  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  48.09 
 
 
239 aa  187  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  48.09 
 
 
239 aa  187  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  49.26 
 
 
201 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  54.4 
 
 
195 aa  187  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  49.26 
 
 
201 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  52.02 
 
 
186 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  51.43 
 
 
188 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
220 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 
187 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 
192 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  51.43 
 
 
184 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>