More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1075 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
213 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  98.12 
 
 
213 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  81.6 
 
 
213 aa  349  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  71.71 
 
 
222 aa  309  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  74.33 
 
 
201 aa  290  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  69.61 
 
 
206 aa  285  4e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  72.58 
 
 
205 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  65.79 
 
 
219 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  65.26 
 
 
219 aa  275  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  61.57 
 
 
272 aa  274  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  69.54 
 
 
204 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  67.91 
 
 
242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  68.53 
 
 
204 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  65.24 
 
 
269 aa  266  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  65.24 
 
 
269 aa  266  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  63.64 
 
 
269 aa  262  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  63.27 
 
 
213 aa  262  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  62.56 
 
 
229 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  61.34 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  61.03 
 
 
229 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  59.79 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  61.29 
 
 
229 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  59.28 
 
 
241 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  59.49 
 
 
232 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  60.11 
 
 
205 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  59.57 
 
 
213 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
234 aa  240  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 
222 aa  240  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  54.73 
 
 
212 aa  238  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 
211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  54.01 
 
 
209 aa  234  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  59.14 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  53.76 
 
 
212 aa  231  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 
212 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 
203 aa  230  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 
205 aa  230  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
206 aa  229  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
258 aa  228  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  53.72 
 
 
209 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 
209 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
236 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
242 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
292 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
292 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
292 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
292 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
292 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 
190 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 
203 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 
211 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 
209 aa  225  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 
211 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  51.6 
 
 
211 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  55.12 
 
 
216 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  52.43 
 
 
210 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  50.49 
 
 
203 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 
190 aa  222  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  57.61 
 
 
213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 
214 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 
214 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  54.03 
 
 
218 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  56.52 
 
 
235 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 
235 aa  215  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  54.17 
 
 
212 aa  214  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 
235 aa  213  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  57.8 
 
 
202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 
226 aa  211  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  57.61 
 
 
202 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  53.45 
 
 
179 aa  211  7e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  56.18 
 
 
243 aa  211  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  57.07 
 
 
219 aa  211  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  56.11 
 
 
210 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 
206 aa  210  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 
239 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 
239 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  52.22 
 
 
206 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 
207 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
198 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  56.35 
 
 
201 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  56.52 
 
 
202 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  56.35 
 
 
201 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  56.35 
 
 
201 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 
197 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  55.8 
 
 
234 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  51.74 
 
 
214 aa  207  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  52.36 
 
 
210 aa  207  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 
247 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  50.24 
 
 
223 aa  205  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  54.35 
 
 
220 aa  205  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 
219 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 
193 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 
218 aa  204  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  51.61 
 
 
204 aa  205  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  52.91 
 
 
200 aa  204  8e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  54.8 
 
 
223 aa  204  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 
194 aa  204  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  54.29 
 
 
187 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 
206 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  48.29 
 
 
209 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 
195 aa  202  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>