176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3641 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  100 
 
 
333 aa  682    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  47.78 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  51.29 
 
 
345 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  49.19 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  48.22 
 
 
329 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  48.54 
 
 
330 aa  279  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  45.89 
 
 
314 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  46.52 
 
 
315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  45.28 
 
 
344 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  44.62 
 
 
314 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  44.65 
 
 
315 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  44.3 
 
 
314 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  45.89 
 
 
333 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  43.71 
 
 
314 aa  258  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 
347 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  45.12 
 
 
333 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  43.23 
 
 
303 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  42.46 
 
 
330 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  42.68 
 
 
331 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  42.68 
 
 
331 aa  232  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  43.41 
 
 
323 aa  232  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 
337 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  40.51 
 
 
324 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  39.87 
 
 
324 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  36.88 
 
 
332 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  36.75 
 
 
317 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
317 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  32.75 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
320 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 
314 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
315 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  31.48 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  33.77 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  31.27 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  34.71 
 
 
345 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  35.4 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  30.9 
 
 
333 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  29.7 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  33.44 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  33.76 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  34.7 
 
 
337 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  34.7 
 
 
337 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  33.69 
 
 
330 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  28.23 
 
 
638 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
314 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 
337 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 
317 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  32.9 
 
 
327 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  32.9 
 
 
327 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  32.9 
 
 
327 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 
327 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  34.07 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  36.24 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  31.92 
 
 
330 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  30.56 
 
 
331 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  33.46 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  33.9 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  33.9 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  30.2 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  30.2 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  33.9 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  33.9 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  33.56 
 
 
338 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  31.99 
 
 
330 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  34.47 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  34.47 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  34.47 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  34.47 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  34.47 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  34.47 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  34.47 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  34.47 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  34.47 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  26.67 
 
 
334 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  30.19 
 
 
329 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  25.28 
 
 
318 aa  102  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  26.4 
 
 
329 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  28.28 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  29.25 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 
290 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.61 
 
 
291 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  24.25 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  26.16 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  24.41 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5068  lysophospholipase-like protein  26.16 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5214  lipase  25.64 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  25.94 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>