More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2176 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  210  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  68.57 
 
 		 107 aa  166  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  69.23 
 
 		 107 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  69.9 
 
 		 119 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  80 
 
 		 107 aa  163  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  69.9 
 
 		 106 aa  163  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  68.93 
 
 		 106 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  66.98 
 
 		 107 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  68.63 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  64.15 
 
 		 106 aa  149  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  62.26 
 
 		 107 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  63.21 
 
 		 106 aa  147  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  61.32 
 
 		 107 aa  146  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  61.76 
 
 		 107 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  59.43 
 
 		 106 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  60.38 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  62.26 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  60.78 
 
 		 107 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  60.78 
 
 		 107 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  59.22 
 
 		 106 aa  140  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  60.38 
 
 		 106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  59.22 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  59.05 
 
 		 106 aa  137  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  57.69 
 
 		 108 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  52.38 
 
 		 111 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  60 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  58.25 
 
 		 108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  59.18 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  58.65 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  56.19 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  51.89 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  56.19 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  56.31 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  59.05 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  56.19 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  55.66 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  57.58 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  57.58 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  56.19 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  54 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  60.61 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  59.6 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  56.31 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  59.6 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  51.43 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  57.73 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  58.59 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  50.48 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  54.46 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  53.92 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  56.31 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  56.19 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  54.37 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  55.45 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  49.51 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  51.43 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  56.57 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  57.58 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  55.77 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>