More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1619 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  73.31 
 
 
470 aa  689  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  100 
 
 
481 aa  951  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  60.35 
 
 
473 aa  541  1e-152  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  61.18 
 
 
472 aa  508  1e-142  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  60.79 
 
 
473 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  60.88 
 
 
473 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  61.32 
 
 
473 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  55.7 
 
 
470 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  53.52 
 
 
473 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  52.75 
 
 
471 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  52.19 
 
 
471 aa  445  1e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  53.04 
 
 
471 aa  446  1e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  53.07 
 
 
471 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  49.2 
 
 
461 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  45.13 
 
 
476 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  51.66 
 
 
462 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  45.09 
 
 
459 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  45.87 
 
 
444 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  43.9 
 
 
481 aa  362  9e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  45.76 
 
 
459 aa  353  3e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  43.94 
 
 
471 aa  353  3e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  43.71 
 
 
485 aa  353  3e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  45.77 
 
 
462 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  43.08 
 
 
479 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  43.13 
 
 
463 aa  328  1e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  45.32 
 
 
460 aa  327  2e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3159  magnesium transporter  40.5 
 
 
489 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  38.26 
 
 
445 aa  283  4e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  38.58 
 
 
453 aa  283  5e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0458  divalent cation transporter  33.75 
 
 
456 aa  280  3e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  37.18 
 
 
445 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0571  magnesium transporter  32.08 
 
 
456 aa  275  1e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  36.43 
 
 
422 aa  269  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  36.77 
 
 
453 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  35.43 
 
 
491 aa  267  3e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  35.43 
 
 
491 aa  267  3e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  35.43 
 
 
491 aa  267  3e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  35.84 
 
 
452 aa  266  6e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  36.05 
 
 
453 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  36.43 
 
 
480 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  36.43 
 
 
480 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  36 
 
 
477 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  36.43 
 
 
480 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  33.94 
 
 
453 aa  263  7e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  36.19 
 
 
480 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  36.74 
 
 
454 aa  260  5e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  35.95 
 
 
480 aa  259  5e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  35.48 
 
 
480 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  36.6 
 
 
442 aa  256  9e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  34.1 
 
 
480 aa  255  1e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  35.71 
 
 
480 aa  255  1e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  36.88 
 
 
482 aa  254  2e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  34.93 
 
 
478 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  37.39 
 
 
452 aa  253  4e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  33.18 
 
 
454 aa  253  5e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  35 
 
 
480 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  33.56 
 
 
455 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  35.31 
 
 
482 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  35.31 
 
 
482 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  35.2 
 
 
479 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  33.41 
 
 
452 aa  249  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.40775e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  33.18 
 
 
454 aa  249  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0375  magnesium transporter  31.27 
 
 
456 aa  247  4e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  32.95 
 
 
454 aa  246  7e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  32.95 
 
 
454 aa  246  1e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  33.33 
 
 
481 aa  245  1e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  34.43 
 
 
455 aa  244  2e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  32.95 
 
 
454 aa  245  2e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  38.01 
 
 
494 aa  244  2e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  32.73 
 
 
454 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  32.27 
 
 
454 aa  243  8e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  37.06 
 
 
453 aa  242  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  32.27 
 
 
454 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  32.27 
 
 
454 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  32.05 
 
 
454 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  35.43 
 
 
492 aa  240  3e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  32.35 
 
 
452 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  35.82 
 
 
455 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  31.47 
 
 
454 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  1.95953e-08 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  35.63 
 
 
450 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  31.14 
 
 
454 aa  236  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  34 
 
 
453 aa  236  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  34.01 
 
 
450 aa  235  1e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  34.05 
 
 
481 aa  234  2e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  30.36 
 
 
454 aa  233  7e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  34.97 
 
 
492 aa  233  8e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  33.79 
 
 
451 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  35.24 
 
 
480 aa  230  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  31.74 
 
 
454 aa  229  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  32.64 
 
 
444 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  32.54 
 
 
449 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  36.82 
 
 
455 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1221  Mg/Co/Ni transporter, MgtE family  35.23 
 
 
447 aa  226  6e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00221531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  32.88 
 
 
451 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  36.07 
 
 
478 aa  223  5e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  32.65 
 
 
452 aa  223  5e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  31.74 
 
 
453 aa  222  1e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  30.25 
 
 
451 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.41787e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  33.03 
 
 
451 aa  220  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  32.09 
 
 
450 aa  219  9e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  2.6878e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>