More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25470 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  100 
 
 
442 aa  837    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  51.18 
 
 
448 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  49.88 
 
 
442 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  49.26 
 
 
418 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  48.58 
 
 
446 aa  348  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 
423 aa  343  4e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  46.8 
 
 
437 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  47.54 
 
 
426 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  47.54 
 
 
426 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 
447 aa  323  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  53.1 
 
 
460 aa  320  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  47.95 
 
 
447 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  47.83 
 
 
443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 
438 aa  285  8e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  45.3 
 
 
441 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  42.11 
 
 
398 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  42.36 
 
 
428 aa  269  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 
439 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 
430 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 
486 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  39.33 
 
 
446 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  36.29 
 
 
430 aa  192  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
411 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
421 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  28.18 
 
 
428 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.15 
 
 
430 aa  110  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.15 
 
 
430 aa  110  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
421 aa  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.28 
 
 
434 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28.43 
 
 
432 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.43 
 
 
432 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.14 
 
 
445 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  25.92 
 
 
417 aa  97.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  28.4 
 
 
432 aa  96.3  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
437 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  26.33 
 
 
452 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  26.33 
 
 
452 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  24.23 
 
 
423 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28.84 
 
 
434 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  23.99 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  24.22 
 
 
432 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  23.98 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  25.27 
 
 
418 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  24.66 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  27.86 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  22.04 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  22.62 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  24.39 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  23.54 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  23.54 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  23.76 
 
 
443 aa  79.7  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  26.99 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  23.53 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  26.99 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  21.5 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  21.82 
 
 
434 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  23.3 
 
 
431 aa  77  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  23.57 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  25 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  24.76 
 
 
425 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  24.76 
 
 
425 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  26.26 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  24.36 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  25.07 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  24.3 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  22.83 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  29.71 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  25.07 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  23.13 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  23.13 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  23.93 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  23.93 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  25.39 
 
 
420 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  25.17 
 
 
441 aa  69.7  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  36.05 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  24.6 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  24.49 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  24.49 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  23.96 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  27.67 
 
 
412 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  22.53 
 
 
443 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  25.09 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  23.26 
 
 
453 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  23.97 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  23.82 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 
426 aa  64.3  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  23.75 
 
 
439 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  23.55 
 
 
366 aa  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>