More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  100 
 
 		 122 aa  254  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  70.59 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  62.83 
 
 		 117 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  61.79 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  60.68 
 
 		 120 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  61.54 
 
 		 120 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  59.48 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  60.83 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  54.92 
 
 		 123 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  56.3 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  57.14 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  54.47 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  58.97 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  53.72 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  57.14 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  54.92 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  53.28 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  53.78 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  53.28 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  56.9 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  54.87 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  54.62 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  56.2 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  56.9 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  56.9 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  57.02 
 
 		 123 aa  137  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  58.41 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  51.26 
 
 		 125 aa  137  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  53.78 
 
 		 123 aa  136  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  54.87 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  55.37 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  55.37 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  56.64 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  54.46 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  55.56 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  54.87 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  54.87 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  54.47 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  54.55 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  50.82 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  53.57 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  50.89 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  50.86 
 
 		 125 aa  127  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  55.96 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  48.36 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  50 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  52.94 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  51.67 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  51.24 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  47.54 
 
 		 123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  52.1 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  54.17 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  53.78 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  50 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  45.9 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  52.07 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  52.1 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  52.1 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  50 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  48.62 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  39.29 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  38.39 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  39.47 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  39.47 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  45.19 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  38.46 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  41.82 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  47.25 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  45.1 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  47.25 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  44.21 
 
 		 178 aa  90.5  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  46.15 
 
 		 170 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  38.39 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  46.15 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  46.15 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  47.67 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  45.63 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  40.22 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  41.12 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  43.96 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  45.57 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  43.96 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  40.59 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  40.59 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  40.59 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  39.22 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  35.64 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>