More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6901 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
328 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.54 
 
 
325 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.33 
 
 
331 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.7 
 
 
331 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.75 
 
 
332 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.56 
 
 
332 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.59 
 
 
329 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.48 
 
 
325 aa  350  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.4 
 
 
323 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.89 
 
 
342 aa  349  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.94 
 
 
332 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  54.43 
 
 
324 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.76 
 
 
328 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.94 
 
 
332 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.94 
 
 
332 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  55.14 
 
 
328 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.94 
 
 
330 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.63 
 
 
324 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.89 
 
 
324 aa  339  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.58 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.11 
 
 
326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.31 
 
 
323 aa  335  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.57 
 
 
324 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.47 
 
 
326 aa  333  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.07 
 
 
323 aa  330  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.01 
 
 
334 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.58 
 
 
335 aa  329  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.22 
 
 
328 aa  328  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.06 
 
 
328 aa  328  7e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.7 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.94 
 
 
325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.08 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.52 
 
 
324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.71 
 
 
328 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.26 
 
 
323 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.16 
 
 
330 aa  315  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.6 
 
 
325 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.11 
 
 
339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  52.35 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.13 
 
 
327 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.43 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.03 
 
 
319 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.71 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03300  2-nitropropane dioxygenase, putative  44.41 
 
 
340 aa  243  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29975  predicted protein  45.17 
 
 
346 aa  236  4e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  44.66 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08801  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09600)  49.22 
 
 
269 aa  230  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.196554  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.98 
 
 
322 aa  225  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  41.08 
 
 
317 aa  225  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.81 
 
 
313 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.44 
 
 
309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  40.97 
 
 
316 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.75 
 
 
315 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.17 
 
 
323 aa  208  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.71 
 
 
317 aa  205  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.41 
 
 
313 aa  205  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.23 
 
 
316 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  39.06 
 
 
321 aa  202  7e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  38.92 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  36.48 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.76 
 
 
319 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.42 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.89 
 
 
325 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.25 
 
 
316 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  37.79 
 
 
311 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.1 
 
 
311 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.51 
 
 
312 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  41.21 
 
 
320 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.24 
 
 
319 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.86 
 
 
386 aa  185  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  36.13 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.79 
 
 
314 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.79 
 
 
314 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  37.5 
 
 
323 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.54 
 
 
316 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.74 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.98 
 
 
353 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.49 
 
 
311 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04811  conserved hypothetical protein  34.07 
 
 
278 aa  169  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  35.81 
 
 
314 aa  169  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.25 
 
 
313 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.78 
 
 
313 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.61 
 
 
354 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.55 
 
 
353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.33 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.46 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  35.63 
 
 
355 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.47 
 
 
356 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2605  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.69 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152274  normal  0.24366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.95 
 
 
351 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.23 
 
 
356 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.23 
 
 
356 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.23 
 
 
356 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6837  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.02 
 
 
330 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2734  putative 2-nitropropane dioxygenase  35.49 
 
 
319 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.68 
 
 
358 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  35.01 
 
 
361 aa  155  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2746  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.65 
 
 
362 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.881958  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3984  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.14 
 
 
361 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
338 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>