More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4592 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0519  ABC transporter, permease protein  91.57 
 
 		 356 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2561  ABC transporter, permease protein  91.29 
 
 		 356 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1252  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  98.31 
 
 		 356 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.19 
 
 		 356 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.07 
 
 		 356 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1049  ABC transporter, permease protein  91.57 
 
 		 356 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.6 
 
 		 356 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.076951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 356 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1391  ABC transporter, permease protein  91.57 
 
 		 356 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0350688  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.47 
 
 		 356 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0210654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 356 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1310  ABC transporter, permease protein  91.57 
 
 		 356 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0248  ABC transporter, permease protein  91.57 
 
 		 356 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1443  ABC transporter, permease protein  92.42 
 
 		 330 aa  614  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1275  ABC transporter, permease protein  92.56 
 
 		 336 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.572487  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.71 
 
 		 356 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.46 
 
 		 356 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0196  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  79.49 
 
 		 356 aa  564  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.18 
 
 		 356 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.31 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0789045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.99 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.31 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  61.23 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.11 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.35 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.31 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.92 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0522734  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.18 
 
 		 356 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.94 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.84 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.15 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.15 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.38 
 
 		 365 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.74 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.54 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.857231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.78 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0806  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppB  60.78 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.557497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.5 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3249  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB, putative  62.46 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0957202  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.33 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.58 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1029  dipeptide ABC transporter, permease protein  50.98 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.234633  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.22 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285903  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.75 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.87 
 
 		 364 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582701  hitchhiker  0.00744073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.43 
 
 		 342 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240236  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.28 
 
 		 336 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.34 
 
 		 336 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.45 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.28 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.85 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0800  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.66 
 
 		 356 aa  322  8e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.13 
 
 		 340 aa  312  6.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4039  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  48.99 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3552  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease protein  48.99 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.99 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.26 
 
 		 352 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.239018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.66 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.18 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.6 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0835992  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 		 334 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.06 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  44.86 
 
 		 336 aa  258  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.43 
 
 		 336 aa  255  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  44.34 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  41.79 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  45.37 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  45.37 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  45.37 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  45.37 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  45.37 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  42.37 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  45.65 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  45.34 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  45.65 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  45.06 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  45.06 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  45.06 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  45.06 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  45.06 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  45.06 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  45.06 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  45.06 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  44.72 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  45.06 
 
 		 381 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  45.03 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.99 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 		 334 aa  246  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 		 334 aa  245  8e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  44.72 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.94 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  44.72 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  42.29 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  40.75 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>