141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3779 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  56.39 
 
 
3501 aa  2297    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  41.22 
 
 
3165 aa  668    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.33 
 
 
2782 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  33.39 
 
 
3322 aa  962    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  56.25 
 
 
3552 aa  2313    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  58.5 
 
 
3079 aa  2805    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.07 
 
 
3020 aa  1333    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  45.69 
 
 
3131 aa  987    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  43.64 
 
 
3141 aa  1772    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  70.92 
 
 
541 aa  692    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  40.2 
 
 
3147 aa  1413    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  43.45 
 
 
3301 aa  1409    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  59.54 
 
 
2984 aa  2732    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  36.61 
 
 
3004 aa  1010    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
3028 aa  5873    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  45.27 
 
 
3144 aa  982    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  45.65 
 
 
3141 aa  988    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  48.31 
 
 
3159 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  43.61 
 
 
3141 aa  1773    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  30.86 
 
 
3526 aa  643    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.08 
 
 
3128 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.43 
 
 
3602 aa  629  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.76 
 
 
3884 aa  614  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  38.62 
 
 
3081 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  62.7 
 
 
1038 aa  497  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.44 
 
 
2545 aa  427  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  28.46 
 
 
2588 aa  424  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  28.41 
 
 
2530 aa  423  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  33.3 
 
 
1998 aa  417  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  31.01 
 
 
3350 aa  410  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.38 
 
 
2600 aa  406  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.75 
 
 
3862 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.85 
 
 
3040 aa  380  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.08 
 
 
2421 aa  367  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.86 
 
 
2345 aa  355  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.81 
 
 
3790 aa  354  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  31.84 
 
 
3563 aa  352  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.34 
 
 
3796 aa  351  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  30.83 
 
 
3443 aa  350  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.74 
 
 
3967 aa  345  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  32.57 
 
 
5212 aa  345  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  30.29 
 
 
2758 aa  337  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  33.94 
 
 
6274 aa  335  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.43 
 
 
658 aa  329  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.09 
 
 
3475 aa  327  3e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.64 
 
 
3480 aa  319  5e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.44 
 
 
3378 aa  313  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  29.4 
 
 
3300 aa  313  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  37.5 
 
 
710 aa  294  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.89 
 
 
4966 aa  285  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  32.37 
 
 
1268 aa  276  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  49.86 
 
 
3785 aa  275  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.53 
 
 
2670 aa  250  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  42.43 
 
 
594 aa  249  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  34.88 
 
 
1077 aa  245  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.22 
 
 
5981 aa  238  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.97 
 
 
1730 aa  236  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.97 
 
 
812 aa  228  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  31.17 
 
 
1052 aa  225  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  34.75 
 
 
857 aa  223  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  30.76 
 
 
2061 aa  214  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3272  hypothetical protein  33.9 
 
 
763 aa  213  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  29.69 
 
 
2827 aa  212  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  30.63 
 
 
2904 aa  207  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  40.63 
 
 
1723 aa  203  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.82 
 
 
428 aa  193  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  29.21 
 
 
991 aa  186  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  29.71 
 
 
2536 aa  180  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  26.82 
 
 
1270 aa  179  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  35.13 
 
 
2449 aa  176  5.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.77 
 
 
923 aa  167  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.79 
 
 
721 aa  161  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.43 
 
 
2818 aa  160  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  29.24 
 
 
1571 aa  156  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  24.79 
 
 
2651 aa  146  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  27.46 
 
 
2691 aa  142  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.76 
 
 
2666 aa  139  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  32.41 
 
 
2737 aa  137  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.19 
 
 
2847 aa  136  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  31.39 
 
 
1719 aa  135  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  24.32 
 
 
2732 aa  134  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  32.34 
 
 
2350 aa  134  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  32.66 
 
 
915 aa  134  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  32.1 
 
 
1841 aa  130  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0521  hypothetical protein  35.21 
 
 
412 aa  130  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.718593  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  26.11 
 
 
2547 aa  126  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.67 
 
 
2786 aa  126  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  34.78 
 
 
1618 aa  123  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.47 
 
 
1508 aa  122  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  46.34 
 
 
848 aa  122  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  23.69 
 
 
2542 aa  122  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  32.63 
 
 
3929 aa  119  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  24.65 
 
 
2964 aa  118  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.98 
 
 
678 aa  115  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  30.84 
 
 
846 aa  114  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  31.78 
 
 
1651 aa  114  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  32.58 
 
 
716 aa  113  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.81 
 
 
678 aa  112  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.96 
 
 
847 aa  111  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  26.41 
 
 
463 aa  111  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>