More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3412 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  96.88 
 
 		 385 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  94.29 
 
 		 385 aa  720    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  94.03 
 
 		 385 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  94.29 
 
 		 385 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 385 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  94.29 
 
 		 385 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  94.29 
 
 		 385 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  77.72 
 
 		 387 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  76.62 
 
 		 385 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.44 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.1 
 
 		 388 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 		 388 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 		 388 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.05 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.05 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.76 
 
 		 380 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  60.15 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.66 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.12 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.77 
 
 		 391 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 		 386 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  58.87 
 
 		 387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.44 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.15 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  53.73 
 
 		 387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.98 
 
 		 387 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.81 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  52.85 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.93 
 
 		 387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.93 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.28 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.73 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.78 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 388 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 		 388 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.28 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.28 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 383 aa  229  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 		 388 aa  225  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.95 
 
 		 385 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  37.43 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.43 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.44 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 383 aa  213  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.72 
 
 		 388 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 		 384 aa  211  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 		 386 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.31 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 		 400 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.31 
 
 		 400 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.03 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 		 392 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.03 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  36.24 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.03 
 
 		 400 aa  206  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  36.46 
 
 		 389 aa  205  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 382 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 382 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 383 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.32 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.15 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>