217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1986 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  91.73 
 
 
259 aa  484  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  99.57 
 
 
234 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  71.19 
 
 
246 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  70.78 
 
 
253 aa  356  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  70.54 
 
 
250 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  70.37 
 
 
258 aa  354  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  67.08 
 
 
258 aa  340  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  51.69 
 
 
244 aa  258  8e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  47.3 
 
 
257 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  44.72 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  45.64 
 
 
254 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  47.03 
 
 
255 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  47.86 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  44.86 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  44.4 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  46.89 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  43.67 
 
 
248 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  47.68 
 
 
255 aa  208  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  43.21 
 
 
246 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  46.09 
 
 
244 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  46.09 
 
 
250 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  46.09 
 
 
250 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  47.77 
 
 
244 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  44.22 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  44.67 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  45.05 
 
 
248 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
277 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  38.02 
 
 
262 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  38.02 
 
 
262 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  39 
 
 
262 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  35.92 
 
 
248 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  35.48 
 
 
256 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
235 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  37.8 
 
 
253 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  39.24 
 
 
260 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
255 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  34.34 
 
 
261 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  31 
 
 
257 aa  72  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  30.67 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  29.24 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  28.88 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  29.21 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  29.05 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  29.83 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  29.83 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  28.4 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  28.4 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  28.4 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  28.4 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  28.4 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  28.4 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  28.4 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  28.4 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  24.26 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  28.05 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  28.98 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  29.15 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.33 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  40.23 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.2 
 
 
207 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  26.67 
 
 
238 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  27.33 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  27.33 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1896  hypothetical protein  26.67 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  25.14 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  28.85 
 
 
281 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
207 aa  52  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
241 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  28.15 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  25.76 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  32.99 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  28.74 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  29.1 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.8813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>