More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1924 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3776  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  3.25408e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3478  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  8.79138e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3804  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
223 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000896818  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3746  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  2.1686e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1924  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  1.32844e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2632  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  4.88611e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3068  50S ribosomal protein L3  99.09 
 
 
219 aa  433  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  7.18216e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3169  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  2.63976e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3644  50S ribosomal protein L3  95.89 
 
 
219 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.85363e-09  hitchhiker  2.00291e-11 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0314  50S ribosomal protein L3  95.89 
 
 
219 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.38197e-08  hitchhiker  0.00855725 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  95.89 
 
 
219 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  1.11519e-07  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0249  50S ribosomal protein L3  94.91 
 
 
216 aa  414  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.58016e-10  normal  0.145495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0327  50S ribosomal protein L3  94.44 
 
 
216 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  9.00525e-05  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  94.91 
 
 
217 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  1.08395e-11  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0348  50S ribosomal protein L3  94.44 
 
 
217 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000116037  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2759  50S ribosomal protein L3  94.44 
 
 
217 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  3.32087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0267  50S ribosomal protein L3  93.98 
 
 
217 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  4.16166e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0276  50S ribosomal protein L3  93.98 
 
 
216 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  7.62346e-07  normal  0.121842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  85.65 
 
 
217 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  2.76942e-07  decreased coverage  1.34206e-07 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  85.65 
 
 
217 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  5.38385e-07  hitchhiker  8.07722e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  84.11 
 
 
214 aa  367  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  4.49005e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  83.64 
 
 
216 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  1.28128e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3019  50S ribosomal protein L3  82.63 
 
 
220 aa  348  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  2.16849e-05  hitchhiker  0.0059333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0053  50S ribosomal protein L3  77 
 
 
218 aa  328  4e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  5.06419e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3999  50S ribosomal protein L3  73.15 
 
 
226 aa  327  1e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.66113e-07 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0338  50S ribosomal protein L3  71.69 
 
 
224 aa  324  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  2.74222e-06  decreased coverage  0.000311926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1264  50S ribosomal protein L3  71.69 
 
 
224 aa  324  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00436289  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0273  50S ribosomal protein L3  72.94 
 
 
224 aa  323  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  3.66458e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0278  50S ribosomal protein L3  72.94 
 
 
224 aa  323  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000211938  decreased coverage  1.29288e-09 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0391  50S ribosomal protein L3  72.02 
 
 
224 aa  323  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  6.98132e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4913  50S ribosomal protein L3  72.85 
 
 
226 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00251627  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0050  50S ribosomal protein L3  75.12 
 
 
218 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  1.05165e-13  decreased coverage  1.58179e-26 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3443  50S ribosomal protein L3  73.61 
 
 
247 aa  321  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000129848  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3795  50S ribosomal protein L3  71.75 
 
 
228 aa  318  4e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  1.67739e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0767  ribosomal protein L3  73.58 
 
 
236 aa  318  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.357159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  73.93 
 
 
212 aa  313  1e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.14788e-24  hitchhiker  3.84813e-05 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  72.04 
 
 
212 aa  311  3e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  2.54045e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  71.09 
 
 
214 aa  311  6e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  3.24929e-11  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  69.16 
 
 
214 aa  298  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  3.338e-09  unclonable  1.02958e-07 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0256  50S ribosomal protein L3  71.69 
 
 
227 aa  296  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  1.72376e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0203  50S ribosomal protein L3  71.36 
 
 
226 aa  290  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459073  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  62.44 
 
 
214 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  6.58885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  63.16 
 
 
209 aa  265  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  62.44 
 
 
214 aa  263  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.7151e-11  hitchhiker  1.66028e-07 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  60.38 
 
 
215 aa  263  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  64.32 
 
 
211 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  62.2 
 
 
209 aa  261  5e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.9924e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  64.79 
 
 
211 aa  261  7e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.30335e-05  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  61.61 
 
 
212 aa  261  7e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  1.5584e-06  hitchhiker  7.58128e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  64.79 
 
 
211 aa  261  7e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  62.91 
 
 
211 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  62.91 
 
 
211 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  8.38631e-08  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  62.91 
 
 
211 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  2.09689e-07 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  62.56 
 
 
209 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  62.44 
 
 
211 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.74535e-10  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  62.2 
 
 
209 aa  258  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  62.2 
 
 
209 aa  258  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.83333e-10  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  62.2 
 
 
209 aa  258  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.56273e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0323  50S ribosomal protein L3  61.97 
 
 
214 aa  259  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  3.34047e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  62.44 
 
 
211 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  1.65351e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  61.72 
 
 
209 aa  258  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.45621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  62.2 
 
 
209 aa  258  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.22247e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  61.24 
 
 
209 aa  257  9e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  61.97 
 
 
211 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  60 
 
 
216 aa  256  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  3.85888e-10  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  61.24 
 
 
209 aa  253  1e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  3.54089e-10  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0337  50S ribosomal protein L3  56.81 
 
 
217 aa  252  2e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.73756e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  62.2 
 
 
209 aa  253  2e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.63503e-07  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  59.81 
 
 
209 aa  251  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1854  50S ribosomal protein L3  56.34 
 
 
217 aa  251  8e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000292484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04521  50S ribosomal protein L3  59.22 
 
 
207 aa  250  9e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  5.54969e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  62.2 
 
 
208 aa  250  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.58228e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  56.87 
 
 
212 aa  250  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  59.24 
 
 
212 aa  250  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  5.25785e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  59.81 
 
 
209 aa  250  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  9.94751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  59.81 
 
 
209 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.33554e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.0519e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  249  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.14725e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  249  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.38592e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  58.29 
 
 
212 aa  249  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.66431e-08  unclonable  2.47869e-08 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  249  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  6.66979e-07  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  249  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.09233e-06  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  249  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.24545e-06  normal  0.0362623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  249  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.56822e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  60.77 
 
 
209 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  57.28 
 
 
218 aa  249  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  59.81 
 
 
212 aa  247  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  57.82 
 
 
212 aa  248  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.06645e-07  decreased coverage  4.70561e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3807  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.42393e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3636  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.45749e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3636  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  3.30914e-05  normal  0.241535 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3744  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00311101  normal  0.0177476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3709  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
209 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000323926  normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  57.35 
 
 
212 aa  246  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  57.35 
 
 
212 aa  247  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  7.26152e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  57.82 
 
 
212 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.15109e-07  unclonable  5.79905e-11 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  57.75 
 
 
214 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  59.24 
 
 
210 aa  245  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  59.24 
 
 
210 aa  245  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  4.71094e-09 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>