More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0007 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0007  nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 
144 aa  295  1e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 
143 aa  193  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  64.49 
 
 
143 aa  192  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 
143 aa  191  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2896  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 
143 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 
143 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 
143 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 
143 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 
143 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 
143 aa  189  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 
143 aa  188  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 
143 aa  188  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  63.77 
 
 
143 aa  188  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 
143 aa  188  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 
143 aa  188  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 
143 aa  188  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  63.77 
 
 
143 aa  188  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 
143 aa  188  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 
142 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 
142 aa  186  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 
142 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  61.87 
 
 
142 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 
141 aa  184  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  60.43 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
141 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
141 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  57.97 
 
 
143 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
141 aa  169  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 
143 aa  168  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 
143 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 
143 aa  167  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 
143 aa  167  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
142 aa  168  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
143 aa  167  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 
143 aa  167  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 
143 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 
143 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  57.97 
 
 
164 aa  167  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  54.29 
 
 
140 aa  167  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
143 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
141 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 
143 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
143 aa  165  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 
141 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  57.89 
 
 
141 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 
141 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
141 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
143 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
143 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
143 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 
141 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
143 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 
141 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  54.35 
 
 
143 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 
143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  53.62 
 
 
143 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 
137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 
143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 
141 aa  163  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 
137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  52.17 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  54.89 
 
 
143 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  53.62 
 
 
143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 
142 aa  160  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  53.96 
 
 
141 aa  159  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 
143 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  56.39 
 
 
135 aa  159  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 
141 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 
137 aa  158  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 
143 aa  158  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 
142 aa  158  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 
141 aa  158  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0387  nucleoside diphosphate kinase  53.57 
 
 
141 aa  157  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  51.41 
 
 
144 aa  157  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 
139 aa  157  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  50.71 
 
 
141 aa  157  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  53.96 
 
 
141 aa  157  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  52.9 
 
 
142 aa  157  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 
141 aa  156  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 
137 aa  156  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 
137 aa  155  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  51.45 
 
 
144 aa  156  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  52.52 
 
 
141 aa  156  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 
141 aa  153  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  49.64 
 
 
141 aa  153  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  52.9 
 
 
140 aa  153  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 
141 aa  153  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>