71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3656 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  100 
 
 
421 aa  845    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  56.46 
 
 
423 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  57.42 
 
 
422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  22.9 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  25.07 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  24.56 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  25 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  26.18 
 
 
422 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  26.18 
 
 
422 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  25.08 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  47.37 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  25.08 
 
 
419 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 
426 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  36 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  36.11 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  36.11 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  35.06 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1433  hypothetical protein  37.5 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1699  hypothetical protein  37.5 
 
 
421 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000791794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  32.47 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  35.82 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  35.82 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  35.82 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  35.82 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  35.82 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
297 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
297 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  38.6 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
298 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 
118 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  38.6 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  32.47 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
298 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  38.6 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  38.6 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  38.6 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  38.6 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
300 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
292 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
292 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1590  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 
456 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  28.57 
 
 
213 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  28.57 
 
 
285 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  28.57 
 
 
285 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  37.74 
 
 
421 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  37.74 
 
 
421 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  25.12 
 
 
435 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  28.57 
 
 
285 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  28.57 
 
 
285 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
287 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  35.62 
 
 
288 aa  46.6  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  35.09 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  27.83 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  28.57 
 
 
285 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  29.79 
 
 
285 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  35.62 
 
 
285 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
115 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
115 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
182 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
132 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 
96 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  33.82 
 
 
404 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  32.2 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 
208 aa  44.3  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  40.38 
 
 
301 aa  43.5  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 
187 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 
190 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
255 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
99 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>