53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6529 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  57.58 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  53.82 
 
 		 302 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  52.58 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  52 
 
 		 299 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  43.27 
 
 		 254 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  41.82 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  40.18 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  30.2 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  42.11 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  41.18 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  38.94 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  36.72 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  39.45 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  39.45 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  47.62 
 
 		 696 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  50.68 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  50.68 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  43.48 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  36.75 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  37.07 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  47.37 
 
 		 230 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  37.07 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  42.03 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  32.04 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  39.73 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  32.48 
 
 		 227 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  39.73 
 
 		 235 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  36.62 
 
 		 231 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  35.14 
 
 		 245 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  45.07 
 
 		 244 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  42.86 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  35.09 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  38.18 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  42.03 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  41.27 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  35.16 
 
 		 260 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  33.64 
 
 		 260 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  32.61 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  54.76 
 
 		 232 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  24.78 
 
 		 237 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  30.51 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  29.63 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  34.68 
 
 		 234 aa  46.2  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  37.31 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  29.75 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  33.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  44.19 
 
 		 238 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0636  putative transmembrane protein  27.07 
 
 		 171 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  36.23 
 
 		 230 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  36.23 
 
 		 233 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>