47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5945 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  810    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  66.31 
 
 		 410 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  55.81 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  50.92 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  50.77 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  48.85 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  51.27 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  45.39 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  49.86 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  48.7 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  48.41 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  47.99 
 
 		 427 aa  322  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  46.03 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  45.65 
 
 		 367 aa  311  9e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  46.81 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  42.55 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  44.17 
 
 		 386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  44.32 
 
 		 424 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  46.24 
 
 		 392 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  44.89 
 
 		 391 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  44.7 
 
 		 411 aa  289  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  43.01 
 
 		 408 aa  288  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  42.63 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  38.5 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  45.41 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  42.09 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  41.84 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  43.3 
 
 		 402 aa  275  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  38.01 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  43.73 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  38.36 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  38.78 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  37.86 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  36.24 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  36.69 
 
 		 406 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  27.66 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  21.71 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  21.05 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  21.98 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3119  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  21.07 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.63 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>