161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4664 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  543  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  70.85 
 
 		 271 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  71.53 
 
 		 276 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  71.17 
 
 		 276 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  69.34 
 
 		 276 aa  374  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  69.74 
 
 		 271 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  65.19 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  64.47 
 
 		 276 aa  357  8e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  63.74 
 
 		 276 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  63.94 
 
 		 277 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  64.31 
 
 		 272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  63.53 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  63.43 
 
 		 276 aa  345  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  62.69 
 
 		 276 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  61.8 
 
 		 281 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  61.8 
 
 		 281 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  59.93 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  41.84 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  52.41 
 
 		 152 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  49.35 
 
 		 182 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  48.34 
 
 		 157 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  48.34 
 
 		 157 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  50.68 
 
 		 152 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  48.34 
 
 		 157 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  54.81 
 
 		 205 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  54.81 
 
 		 205 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  54.81 
 
 		 205 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  54.81 
 
 		 205 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  54.81 
 
 		 205 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  54.81 
 
 		 142 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  54.81 
 
 		 142 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  48.61 
 
 		 150 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  49.65 
 
 		 143 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  47.18 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  46.36 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  45.89 
 
 		 156 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  44.37 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  45.45 
 
 		 155 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.96 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  50.41 
 
 		 128 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  42.65 
 
 		 144 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  35.25 
 
 		 146 aa  93.6  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  34.95 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  31.07 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  41.73 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  38.89 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  37.67 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  36.99 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  39.86 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  32.18 
 
 		 363 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  37.12 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  34.01 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  35.14 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  37.11 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  37.11 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  37.11 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  37.11 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  36.94 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  36.94 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  36.25 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  36.25 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  35.03 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  36.48 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  33.08 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  36.2 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  34.86 
 
 		 335 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  36.2 
 
 		 320 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  29.78 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  36.49 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  31.79 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  34.46 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  34.46 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  37.16 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  32.4 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  30.18 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  33.55 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  33.13 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  36.45 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  54 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 106 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 		 139 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  39.08 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  39.77 
 
 		 113 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 		 115 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  27.03 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  33.67 
 
 		 125 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  31.3 
 
 		 181 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  26.61 
 
 		 133 aa  49.3  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  38.55 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  29.82 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  35.71 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  28.1 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 111 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  28.18 
 
 		 110 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  31.9 
 
 		 142 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 112 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>