More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  99.74 
 
 
381 aa  787    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  99.74 
 
 
381 aa  788    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  100 
 
 
381 aa  789    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  100 
 
 
381 aa  789    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  100 
 
 
381 aa  789    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  100 
 
 
381 aa  789    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  99.74 
 
 
381 aa  787    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  64 
 
 
379 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  64 
 
 
379 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  64 
 
 
379 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  64 
 
 
379 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  64 
 
 
379 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  59.74 
 
 
383 aa  451  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  60 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  59.47 
 
 
383 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  54.38 
 
 
378 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  54.38 
 
 
378 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  54.38 
 
 
378 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  54.38 
 
 
378 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  54.38 
 
 
378 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  54.38 
 
 
378 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  54.38 
 
 
378 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  54.38 
 
 
378 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  54.38 
 
 
378 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  54.23 
 
 
391 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  54.23 
 
 
391 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  54.23 
 
 
391 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  49.87 
 
 
380 aa  353  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  49.86 
 
 
377 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  49.86 
 
 
377 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  49.86 
 
 
377 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  49.86 
 
 
377 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  49.05 
 
 
377 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  49.58 
 
 
369 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  49.58 
 
 
369 aa  342  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  49.87 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  49.87 
 
 
389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  49.87 
 
 
389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  49.87 
 
 
389 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  49.86 
 
 
400 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  58.1 
 
 
385 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  57.75 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  45.19 
 
 
276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  37.96 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  37.8 
 
 
399 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  38.95 
 
 
402 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  38.95 
 
 
402 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  38.95 
 
 
402 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  38.95 
 
 
402 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  36.75 
 
 
391 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0692  Integrase catalytic region  36.77 
 
 
391 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3520  integrase catalytic subunit  34.29 
 
 
392 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.674245  normal  0.0855075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  34.68 
 
 
395 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  34.68 
 
 
395 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  34.68 
 
 
395 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  34.68 
 
 
395 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  34.68 
 
 
395 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  34.68 
 
 
395 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  33.8 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  37.06 
 
 
597 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  33.8 
 
 
382 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  33.52 
 
 
382 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  33.52 
 
 
382 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  33.52 
 
 
382 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
338 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  34.71 
 
 
607 aa  137  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4290  integrase catalytic region  33.08 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3925  integrase catalytic region  33.08 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985941  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4272  integrase catalytic region  33.08 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.489775  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1743  integrase catalytic region  33.08 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107573  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2426  integrase catalytic region  33.08 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.466035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2414  integrase catalytic region  33.08 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  30.95 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  31.31 
 
 
324 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  31.31 
 
 
324 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  31.31 
 
 
324 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  31.31 
 
 
324 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04580  integrase family protein  30.86 
 
 
434 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0865  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2358  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0867438  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2665  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224592  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 
326 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28440  integrase family protein  30.86 
 
 
434 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  30.41 
 
 
326 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>