More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1284 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  100 
 
 
295 aa  604  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  67.61 
 
 
293 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  58.72 
 
 
296 aa  349  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  60.35 
 
 
288 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  60 
 
 
288 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  55.94 
 
 
287 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4418  prephenate dehydratase  60.28 
 
 
284 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  54.61 
 
 
291 aa  288  6e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  45.45 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  42.96 
 
 
276 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  42.5 
 
 
280 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  40.36 
 
 
359 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  44.49 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  42.81 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  40 
 
 
359 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  40.91 
 
 
281 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  36.52 
 
 
274 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  41.11 
 
 
281 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.14 
 
 
284 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  39.86 
 
 
281 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  42.14 
 
 
358 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  40.99 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  41.9 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  38.49 
 
 
311 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  42.01 
 
 
291 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 
277 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 
277 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  37.1 
 
 
276 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  36.59 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  35.62 
 
 
280 aa  178  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.57 
 
 
368 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.21 
 
 
303 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.1 
 
 
373 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.93 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  37.14 
 
 
391 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  35.61 
 
 
377 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  35.09 
 
 
279 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  38.25 
 
 
286 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  35.09 
 
 
279 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  39.29 
 
 
359 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  35.27 
 
 
311 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  35.82 
 
 
283 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.63 
 
 
356 aa  168  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.52 
 
 
362 aa  168  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.65 
 
 
367 aa  168  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  36.46 
 
 
372 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  35.89 
 
 
366 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  35.19 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  36.81 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  36.69 
 
 
418 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  35.36 
 
 
272 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  38.08 
 
 
371 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  36.9 
 
 
278 aa  165  8e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  34.53 
 
 
379 aa  165  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36.3 
 
 
381 aa  165  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  36.43 
 
 
382 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.3 
 
 
364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  36.07 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  36.65 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.69 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  36.3 
 
 
367 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  36.3 
 
 
364 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  38.79 
 
 
360 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  36.3 
 
 
364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  33.57 
 
 
278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.75 
 
 
360 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  37.01 
 
 
359 aa  161  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  36.79 
 
 
358 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  36.3 
 
 
364 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.07 
 
 
387 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  37.23 
 
 
374 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  36.84 
 
 
360 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.72 
 
 
361 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.11 
 
 
355 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  36.3 
 
 
359 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  36.54 
 
 
413 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.43 
 
 
360 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.43 
 
 
360 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.43 
 
 
360 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  37.37 
 
 
365 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.43 
 
 
360 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.43 
 
 
360 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.43 
 
 
360 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.43 
 
 
360 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  37.86 
 
 
366 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  34.63 
 
 
402 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  35.36 
 
 
371 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  36.07 
 
 
356 aa  158  8e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.36 
 
 
371 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  36.04 
 
 
374 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  36.49 
 
 
277 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  36.17 
 
 
359 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  31.8 
 
 
359 aa  158  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  38.3 
 
 
363 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  36.04 
 
 
374 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.72 
 
 
360 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  37.54 
 
 
360 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  37.59 
 
 
288 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  38.65 
 
 
275 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  34.29 
 
 
364 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>