43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1042 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  100 
 
 
550 aa  1136    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  55.26 
 
 
2490 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  60 
 
 
308 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  48.99 
 
 
302 aa  313  6.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  47.69 
 
 
313 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  47.65 
 
 
308 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  46.31 
 
 
307 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  39.46 
 
 
300 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  40.2 
 
 
326 aa  221  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  37.86 
 
 
314 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0643  methyltransferase FkbM family  37.44 
 
 
212 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  31.76 
 
 
339 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  29.5 
 
 
333 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  34.73 
 
 
410 aa  124  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  29.96 
 
 
299 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  29.03 
 
 
416 aa  117  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  26.52 
 
 
298 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4141  hypothetical protein  31.16 
 
 
234 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.607164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  28.17 
 
 
298 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.75 
 
 
2401 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0411  methyltransferase FkbM family  31.66 
 
 
239 aa  100  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.359449  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  24.65 
 
 
313 aa  99.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1607  hypothetical protein  27.53 
 
 
406 aa  99.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  25.28 
 
 
299 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  23.51 
 
 
305 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0382  FkbM family methyltransferase  28.06 
 
 
242 aa  90.9  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  23.77 
 
 
325 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  26.94 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  23.72 
 
 
575 aa  83.6  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2611  methyltransferase FkbM family  29.41 
 
 
224 aa  82  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  29.48 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  22.95 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  23.27 
 
 
297 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  22.95 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  25.88 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  21.22 
 
 
318 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  29.11 
 
 
357 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2342  FkbM family methyltransferase  26.11 
 
 
681 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  32.95 
 
 
1168 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2951  methyltransferase FkbM family  39.58 
 
 
829 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14981  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  31.76 
 
 
3811 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1793  methyltransferase FkbM  26.67 
 
 
283 aa  44.3  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628642  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  25.44 
 
 
252 aa  43.5  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>