More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4117 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
150 aa  295  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  92.67 
 
 
150 aa  277  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  67.33 
 
 
153 aa  194  4e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  57.24 
 
 
148 aa  171  4e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  56.76 
 
 
149 aa  169  8e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  57.53 
 
 
148 aa  168  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  56.08 
 
 
157 aa  166  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  59.31 
 
 
150 aa  165  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  55.86 
 
 
151 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  55.41 
 
 
149 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  52.03 
 
 
149 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  53.06 
 
 
148 aa  157  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  53.74 
 
 
148 aa  157  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  52.74 
 
 
148 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  54.48 
 
 
148 aa  154  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  54.11 
 
 
151 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  55.41 
 
 
151 aa  151  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  50.68 
 
 
148 aa  151  3e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  51.72 
 
 
148 aa  148  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  55.17 
 
 
148 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  53.74 
 
 
151 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  54.79 
 
 
150 aa  147  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  51.72 
 
 
149 aa  142  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  51.39 
 
 
148 aa  139  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  51.68 
 
 
150 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
148 aa  132  2e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  50 
 
 
151 aa  132  2e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  50.68 
 
 
150 aa  129  1e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 
152 aa  127  5e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 
152 aa  127  5e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 
152 aa  127  5e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 
152 aa  125  1e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  43.05 
 
 
152 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  46.67 
 
 
151 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.15 
 
 
150 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  47.26 
 
 
151 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  44 
 
 
151 aa  119  2e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
151 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  7.81135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.46 
 
 
170 aa  111  4e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
151 aa  110  1e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  5.08651e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
148 aa  108  2e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
147 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  42.47 
 
 
146 aa  107  4e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
151 aa  107  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.57053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
148 aa  106  9e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
151 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
151 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
148 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  3.17895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
171 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.25617e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 
152 aa  103  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.19 
 
 
147 aa  103  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.98897e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 
148 aa  103  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.08464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  40 
 
 
147 aa  102  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.36 
 
 
148 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
165 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  39.46 
 
 
159 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 
194 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 
148 aa  100  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.15624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
149 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
151 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 
152 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 
149 aa  100  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  9.28974e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.23092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  36.3 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  38.46 
 
 
193 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  37.76 
 
 
179 aa  99  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  39.58 
 
 
178 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  36.23 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  38.51 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  38.03 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.45753e-06  hitchhiker  1.02152e-13 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
168 aa  95.9  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  35.42 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
152 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
152 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
152 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  36.94 
 
 
151 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  38.16 
 
 
150 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
152 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 
149 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
152 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
175 aa  93.6  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
147 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
167 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  36.43 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
148 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>