74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2190 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  80.54 
 
 
154 aa  244  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  50 
 
 
181 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  38.41 
 
 
153 aa  94.4  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  42.34 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  41.55 
 
 
144 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  44.76 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  42.76 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  48 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  84  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  43.8 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  47.31 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  41.48 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  39.69 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  40 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  38.13 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  40.3 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  38.69 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  38.03 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  35 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  36.76 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  37.96 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  42.14 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  41.04 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  42.14 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  34.29 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  35.21 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  30.77 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  32.64 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  39.33 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  40.44 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  34.75 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  29.79 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  39.19 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  39.19 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  39.19 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  39.29 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  29.63 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  38.97 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  29.58 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  29.58 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  31.39 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  40.56 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  36.88 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  43.08 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  39.71 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  29.92 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  29.92 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  28.17 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  32.86 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  36.23 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1131  hypothetical protein  30.37 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  42.86 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  32.38 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  28.57 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  24.26 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  34.85 
 
 
455 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.47 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  28.47 
 
 
153 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0563  hypothetical protein  25.58 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.308854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  30.17 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  29.37 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  27.27 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  27.97 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  28.67 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  28.33 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  35.21 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0696  protein of unknown function DUF107  35.06 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  26.43 
 
 
429 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>