More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1921 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  100 
 
 		 354 aa  683    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 		 835 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  43.81 
 
 		 310 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.81 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  42.44 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  40.61 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  41.4 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 345 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 345 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  42.12 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.06 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.81 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  37.06 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  37.94 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  39.71 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.35 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  40.12 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  41.72 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  41.99 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  41.99 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  42.03 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  42.03 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  42.03 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  42.03 
 
 		 311 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  42.41 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 311 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  41.3 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  41.3 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 333 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.88 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  39.88 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 337 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.84 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  39.7 
 
 		 330 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  39.7 
 
 		 330 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  39.7 
 
 		 330 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.75 
 
 		 350 aa  185  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  41.88 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.25 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  40.27 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  39.47 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  40.33 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.62 
 
 		 336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  40.51 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  39.1 
 
 		 335 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  37.9 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  38.53 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  38.36 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  38.53 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  40.18 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  38.11 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  40.33 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2473  monosaccharide-transporting ATPase  40.66 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  38.33 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  39.58 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  38.27 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 341 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  39.23 
 
 		 322 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  39.76 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  41.2 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 336 aa  175  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  38.63 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  38.93 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  36.59 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  38.29 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  38.85 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  37.99 
 
 		 324 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  37.35 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  40 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  37.35 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  39.56 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 309 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  40.12 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  39.54 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  41.47 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  39.54 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>