More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1167 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  100 
 
 
178 aa  350  5e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  45.39 
 
 
225 aa  126  1e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  46.04 
 
 
231 aa  124  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  42.51 
 
 
217 aa  123  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  40.11 
 
 
192 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  42.35 
 
 
187 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  47.45 
 
 
207 aa  120  1e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  44.53 
 
 
213 aa  120  1e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.30249e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  43.97 
 
 
208 aa  119  2e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 
188 aa  118  4e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 
188 aa  118  4e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.14529e-07  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 
188 aa  118  5e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 
188 aa  118  5e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 
188 aa  118  5e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 
188 aa  118  5e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  38.92 
 
 
210 aa  118  5e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 
188 aa  118  5e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 
188 aa  118  5e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 
198 aa  115  2e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  44.78 
 
 
189 aa  115  4e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 
192 aa  115  4e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.07397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  41.3 
 
 
195 aa  114  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  43.66 
 
 
213 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 
192 aa  114  7e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  41.45 
 
 
208 aa  114  9e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  41.45 
 
 
208 aa  114  9e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  44.29 
 
 
180 aa  112  2e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  39.46 
 
 
190 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  38.12 
 
 
181 aa  110  1e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  42.54 
 
 
198 aa  110  1e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  38.75 
 
 
198 aa  109  2e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 
197 aa  108  4e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 
197 aa  108  4e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  39.6 
 
 
194 aa  108  4e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 
197 aa  108  4e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.10847e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  46.56 
 
 
184 aa  108  4e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.37 
 
 
197 aa  108  4e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.7652e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 
197 aa  108  4e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.08072e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 
196 aa  108  4e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  5.38048e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  40.37 
 
 
197 aa  108  4e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  5.06013e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  40.37 
 
 
197 aa  108  4e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  5.87917e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  42.38 
 
 
179 aa  108  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  39.51 
 
 
198 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  39.86 
 
 
210 aa  107  7e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  37.89 
 
 
195 aa  107  9e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  43.29 
 
 
200 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  38.99 
 
 
195 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  37.57 
 
 
208 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  39.75 
 
 
196 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  5.06874e-10  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  40.88 
 
 
224 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.37606e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  38.82 
 
 
191 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  35.26 
 
 
204 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
196 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
196 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
196 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
241 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  36.26 
 
 
211 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
250 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 
197 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  1.90441e-07  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  39.85 
 
 
200 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 
188 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  37.58 
 
 
195 aa  104  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  42.76 
 
 
172 aa  104  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  37.5 
 
 
202 aa  103  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 
195 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 
186 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 
195 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  38.57 
 
 
274 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  42.14 
 
 
189 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  42.76 
 
 
172 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  7.49846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  40.29 
 
 
204 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.8 
 
 
243 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  35.64 
 
 
190 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.60031e-07  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  39.29 
 
 
210 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  45.04 
 
 
185 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 
192 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.65498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  35.29 
 
 
204 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.98101e-09  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 
192 aa  101  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  9.95394e-12  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  39.72 
 
 
226 aa  101  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 
192 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  3.64467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 
200 aa  101  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.5112e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  41.98 
 
 
204 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  37.93 
 
 
181 aa  101  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.81 
 
 
204 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  36.73 
 
 
208 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  39.85 
 
 
247 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  44.27 
 
 
185 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  42.64 
 
 
210 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  33.16 
 
 
202 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.16 
 
 
202 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  46.03 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.13319e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  38.65 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  39.57 
 
 
197 aa  99  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  39.85 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  34.53 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  40.94 
 
 
201 aa  99  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 
192 aa  98.6  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  34.95 
 
 
222 aa  98.2  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  41.18 
 
 
221 aa  98.2  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>