219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0007 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
101 aa  192  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  40.48 
 
 
105 aa  67.8  5e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  41.94 
 
 
104 aa  67.4  6e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 
123 aa  66.6  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 
102 aa  65.9  2e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
113 aa  65.5  2e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 
110 aa  63.2  1e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 
122 aa  62.8  2e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 
110 aa  60.5  7e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 
111 aa  60.5  8e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  4.33544e-05 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 
116 aa  60.5  9e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  31.76 
 
 
123 aa  59.3  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  22.92 
 
 
122 aa  58.5  3e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.96 
 
 
113 aa  58.9  3e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
111 aa  58.5  3e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.07939e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  31.52 
 
 
116 aa  58.5  3e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 
113 aa  58.2  4e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 
109 aa  58.2  4e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 
120 aa  57.8  4e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 
116 aa  57.8  5e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 
113 aa  57.8  5e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 
108 aa  57  8e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 
115 aa  56.2  1e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  56.2  2e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 
111 aa  55.1  3e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 
110 aa  55.1  3e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.25 
 
 
112 aa  55.1  3e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
115 aa  54.3  5e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  29.87 
 
 
111 aa  54.3  6e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 
124 aa  54.3  6e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  24.71 
 
 
116 aa  53.9  7e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  25.29 
 
 
109 aa  53.9  7e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  26.37 
 
 
112 aa  53.9  7e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  23.33 
 
 
106 aa  53.9  7e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.38005e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 
114 aa  53.9  8e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.21 
 
 
112 aa  53.5  9e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 
117 aa  53.5  9e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.89 
 
 
117 aa  53.5  9e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  53.1  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  53.1  1e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 
138 aa  53.1  1e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  53.1  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  30.53 
 
 
108 aa  53.1  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.63049e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 
108 aa  53.1  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  28.09 
 
 
99 aa  52.8  2e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.25 
 
 
111 aa  52.4  2e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.25 
 
 
112 aa  52  2e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  31.25 
 
 
111 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.25 
 
 
111 aa  52.4  2e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  21.28 
 
 
117 aa  52.8  2e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 
145 aa  52.8  2e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  30.95 
 
 
108 aa  51.6  3e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  52  3e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  52  3e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  22.68 
 
 
115 aa  51.6  4e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  51.6  4e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  30.3 
 
 
120 aa  51.2  5e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.21 
 
 
112 aa  50.8  5e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  23.76 
 
 
117 aa  51.2  5e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  26.97 
 
 
99 aa  50.8  6e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 
100 aa  50.8  6e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  23 
 
 
115 aa  50.8  6e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 
112 aa  50.8  7e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26 
 
 
115 aa  50.4  8e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  29.07 
 
 
109 aa  50.4  9e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  29.17 
 
 
111 aa  50.4  9e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.37 
 
 
128 aa  50.1  1e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  22 
 
 
105 aa  50.1  1e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  22.22 
 
 
151 aa  49.7  1e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  26.83 
 
 
157 aa  49.7  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.4 
 
 
111 aa  50.1  1e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 
115 aa  50.1  1e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 
110 aa  50.1  1e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 
113 aa  48.9  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  29.33 
 
 
132 aa  49.3  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 
115 aa  48.9  2e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  27.27 
 
 
151 aa  48.9  2e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25 
 
 
437 aa  48.9  2e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  25.27 
 
 
162 aa  48.9  2e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  25.93 
 
 
111 aa  49.3  2e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  22.55 
 
 
114 aa  48.9  2e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  29.63 
 
 
105 aa  48.5  3e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  25.53 
 
 
100 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26.26 
 
 
101 aa  48.5  3e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  32.31 
 
 
118 aa  48.5  3e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 
116 aa  48.5  3e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 
118 aa  48.5  3e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  31.34 
 
 
114 aa  48.1  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 
103 aa  48.1  4e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  18.56 
 
 
118 aa  48.1  4e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  27.5 
 
 
113 aa  47.8  5e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  31.4 
 
 
111 aa  47.8  6e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1274  anti-sigma-factor antagonist  21.65 
 
 
203 aa  47.8  6e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.85 
 
 
130 aa  47.4  6e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 
116 aa  47.8  6e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  31.4 
 
 
111 aa  47.8  6e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>