More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1168 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 122 aa  246  6e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  46.39 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  47.31 
 
 		 123 aa  87  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  44.33 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  37.27 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  37.27 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  44.09 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  46.07 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  38.94 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  41.82 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  39.36 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  35.09 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  34.48 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  42.71 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  39.09 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  45.57 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  40.22 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  40.45 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  34.51 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  48.61 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.76 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  28.69 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>