219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0025 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0025  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 
300 aa  572  1e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  95 
 
 
300 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0023  XRE family transcriptional regulator  88.37 
 
 
301 aa  494  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.4 
 
 
280 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  42.41 
 
 
284 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  39 
 
 
313 aa  152  6e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.55 
 
 
280 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 
279 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  40.88 
 
 
299 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  36.19 
 
 
284 aa  145  8e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
295 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  37.64 
 
 
287 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  38.66 
 
 
274 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  42.19 
 
 
293 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  39.1 
 
 
276 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  36.6 
 
 
277 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  34.2 
 
 
303 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  39.45 
 
 
278 aa  135  6e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  35.27 
 
 
281 aa  134  1e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 
278 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
284 aa  133  4e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  38.37 
 
 
278 aa  131  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  37.31 
 
 
283 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 
259 aa  129  5e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  32.05 
 
 
276 aa  129  5e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  40.57 
 
 
265 aa  129  7e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  34.35 
 
 
280 aa  128  1e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  39.25 
 
 
281 aa  128  1e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  34.67 
 
 
279 aa  127  2e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  36.98 
 
 
296 aa  127  2e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  33.99 
 
 
317 aa  127  2e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  36.19 
 
 
280 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.66 
 
 
301 aa  126  4e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  37.17 
 
 
303 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  38.79 
 
 
283 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
303 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  40.93 
 
 
284 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 
285 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 
285 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  35.51 
 
 
302 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  37.75 
 
 
302 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  36.53 
 
 
263 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  36.43 
 
 
309 aa  121  1e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  38.37 
 
 
278 aa  122  1e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 
303 aa  122  1e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  34.7 
 
 
287 aa  121  1e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  37.79 
 
 
264 aa  120  2e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  34.73 
 
 
275 aa  121  2e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  36.44 
 
 
301 aa  120  2e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  33.07 
 
 
278 aa  120  2e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  38.49 
 
 
281 aa  120  2e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 
285 aa  121  2e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  33.98 
 
 
299 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  38.17 
 
 
307 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  38.37 
 
 
292 aa  120  4e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  36.43 
 
 
285 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  35.61 
 
 
276 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  34.63 
 
 
293 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  38.76 
 
 
263 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  38.76 
 
 
263 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  37.39 
 
 
288 aa  117  2e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  36.82 
 
 
287 aa  117  2e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  34.81 
 
 
314 aa  117  2e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  5.56405e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  38.91 
 
 
312 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  33.72 
 
 
296 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  32.82 
 
 
282 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
263 aa  115  7e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  35.27 
 
 
266 aa  115  7e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  32.71 
 
 
289 aa  115  1e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 
317 aa  114  2e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  37.5 
 
 
297 aa  114  2e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  37.55 
 
 
285 aa  114  2e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  35.51 
 
 
260 aa  114  2e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  36.86 
 
 
314 aa  114  2e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  39.38 
 
 
258 aa  114  2e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  34.46 
 
 
282 aa  114  2e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
270 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 
284 aa  113  4e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  35.08 
 
 
290 aa  113  4e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 
292 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
293 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2362  helix-turn-helix domain-containing protein  39.61 
 
 
257 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298592  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  37.02 
 
 
282 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  34.39 
 
 
297 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  37.05 
 
 
275 aa  111  1e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 
289 aa  111  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  36.44 
 
 
297 aa  111  1e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  39.42 
 
 
299 aa  112  1e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  34.36 
 
 
294 aa  111  1e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  36.44 
 
 
304 aa  111  2e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  40.55 
 
 
284 aa  110  2e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
269 aa  111  2e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  35.36 
 
 
270 aa  110  2e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  35.92 
 
 
305 aa  110  2e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  36.25 
 
 
298 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
289 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  36.28 
 
 
297 aa  108  8e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  35.2 
 
 
302 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  37.55 
 
 
313 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  36.03 
 
 
297 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>