More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4328 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
138 aa  275  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  85.15 
 
 
101 aa  182  1e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  85.15 
 
 
101 aa  182  1e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  84.16 
 
 
101 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
104 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  50 
 
 
131 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.83343e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 
104 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  98.6  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  3.99206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  47.71 
 
 
136 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  5.98947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
105 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59032e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  97.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 
131 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 
131 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.08547e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
104 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 
103 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  51.92 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.05057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.92 
 
 
198 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.78483e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.1 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  6.19372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.032e-07  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  1.69225e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  50.96 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  5.79103e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  51.49 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.09209e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 
103 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  52.04 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  47.58 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.1212e-14  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  45.87 
 
 
221 aa  93.6  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  49.04 
 
 
104 aa  93.2  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.33447e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  1.56169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  53.4 
 
 
102 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.44419e-06  hitchhiker  2.01625e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.33925e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 
103 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.39742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  92  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  2.86753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  45.19 
 
 
104 aa  92  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.43983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
104 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
104 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  56 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  2.39901e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
188 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.94207e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  45.19 
 
 
258 aa  91.3  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>