More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4318 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  60.56 
 
 
547 aa  676  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  65.73 
 
 
533 aa  705  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  87.03 
 
 
555 aa  990  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  65.73 
 
 
533 aa  706  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  58.1 
 
 
534 aa  658  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  65.84 
 
 
534 aa  703  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  61.74 
 
 
542 aa  666  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  58.76 
 
 
538 aa  644  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  57.95 
 
 
547 aa  639  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  58.63 
 
 
546 aa  655  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  87.93 
 
 
555 aa  1001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  60.04 
 
 
537 aa  659  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  57.86 
 
 
542 aa  639  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  57.58 
 
 
546 aa  642  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  61.21 
 
 
546 aa  692  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  63.3 
 
 
535 aa  696  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  58.03 
 
 
533 aa  637  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  60.7 
 
 
548 aa  684  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  59.85 
 
 
551 aa  650  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  61.54 
 
 
558 aa  686  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  59.59 
 
 
550 aa  672  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  64.79 
 
 
535 aa  700  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  58.14 
 
 
547 aa  640  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  58.64 
 
 
547 aa  640  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  61.81 
 
 
557 aa  705  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  56.91 
 
 
555 aa  635  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  87.75 
 
 
555 aa  996  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  60.86 
 
 
550 aa  662  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  58.35 
 
 
534 aa  640  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  59.74 
 
 
540 aa  656  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  59.07 
 
 
535 aa  649  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  61 
 
 
547 aa  664  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  57.43 
 
 
542 aa  652  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  57.87 
 
 
535 aa  644  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  57.87 
 
 
535 aa  644  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  60.71 
 
 
541 aa  678  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  57.44 
 
 
531 aa  635  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  64.67 
 
 
538 aa  717  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.41143e-09 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  59.81 
 
 
547 aa  647  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  64.42 
 
 
536 aa  726  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  61.59 
 
 
555 aa  693  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  100 
 
 
555 aa  1140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  60.22 
 
 
554 aa  663  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  61.61 
 
 
555 aa  667  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  59.78 
 
 
540 aa  647  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  57.67 
 
 
542 aa  637  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.00969e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  57.86 
 
 
542 aa  639  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  60.89 
 
 
546 aa  664  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  61.78 
 
 
553 aa  687  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  60.73 
 
 
555 aa  672  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  58.26 
 
 
543 aa  645  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  58.56 
 
 
545 aa  636  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  58.89 
 
 
552 aa  642  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  61.99 
 
 
555 aa  672  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1441  CTP synthetase  59.31 
 
 
553 aa  635  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  60.55 
 
 
546 aa  673  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  57.01 
 
 
545 aa  635  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  65.09 
 
 
534 aa  726  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.98786e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00174  CTP synthetase  58.2 
 
 
554 aa  636  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  57.86 
 
 
542 aa  639  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  57.88 
 
 
550 aa  640  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  57.83 
 
 
543 aa  638  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  57.01 
 
 
558 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0566  CTP synthetase  58.38 
 
 
554 aa  632  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  57.85 
 
 
549 aa  631  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  57.5 
 
 
559 aa  632  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  57.69 
 
 
547 aa  633  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  58.07 
 
 
545 aa  631  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  58.44 
 
 
555 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  2.64859e-05 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  57.94 
 
 
542 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  57.94 
 
 
542 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  58.01 
 
 
543 aa  631  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  57.95 
 
 
531 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  57.76 
 
 
542 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  57.22 
 
 
539 aa  630  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  58.86 
 
 
545 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  58.22 
 
 
537 aa  630  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  57.82 
 
 
557 aa  628  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.24409e-06  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0614  CTP synthetase  58.2 
 
 
554 aa  630  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1126  CTP synthetase  58.74 
 
 
554 aa  628  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.116547 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  58.48 
 
 
553 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  56.16 
 
 
555 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  56.55 
 
 
542 aa  625  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  58.2 
 
 
545 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  58.2 
 
 
545 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3267  CTP synthetase  58.2 
 
 
545 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0428959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  58.2 
 
 
545 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  57.44 
 
 
534 aa  625  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0969  CTP synthetase  58.74 
 
 
553 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471871  normal  0.0231208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2562  CTP synthetase  58.73 
 
 
557 aa  624  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542571  normal  0.0982923 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  59.21 
 
 
553 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  57.2 
 
 
543 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  59.03 
 
 
553 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.51 
 
 
535 aa  624  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2019  CTP synthetase  59.04 
 
 
552 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0440235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3086  CTP synthetase  58.2 
 
 
545 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  59.21 
 
 
553 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  59.21 
 
 
553 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  59.21 
 
 
570 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  55.51 
 
 
535 aa  621  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>