222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3661 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
388 aa  770    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 
410 aa  189  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  39.93 
 
 
274 aa  162  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  43.09 
 
 
411 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  43.43 
 
 
432 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  40.94 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  37.67 
 
 
421 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  39.77 
 
 
405 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
499 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  42.04 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  44.23 
 
 
402 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  28.81 
 
 
414 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
403 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  31.12 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.56 
 
 
1340 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
376 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
405 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  38.93 
 
 
404 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
408 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  37.42 
 
 
402 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
360 aa  106  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
417 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  38.33 
 
 
401 aa  106  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
417 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
703 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
389 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 
412 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
456 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
404 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
417 aa  103  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
409 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 
406 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  47.5 
 
 
397 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  42.67 
 
 
413 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
409 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 
416 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
399 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
399 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  35.37 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
401 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  39.86 
 
 
371 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  28.09 
 
 
442 aa  96.3  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  27.1 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
956 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
414 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  29.07 
 
 
443 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  39.86 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  40.58 
 
 
408 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  37.78 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 
1106 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  33.5 
 
 
402 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  33.5 
 
 
402 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
410 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  38.97 
 
 
429 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  32.91 
 
 
399 aa  90.5  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
994 aa  90.1  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  34.48 
 
 
700 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  36.7 
 
 
391 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  27.85 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
407 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  41.07 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  27.96 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 
691 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
691 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
1156 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
691 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
1075 aa  79.3  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  36.96 
 
 
409 aa  79.3  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  27.95 
 
 
1119 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  36.94 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  30.77 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
824 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  35.61 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  34.9 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 
892 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
683 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>