More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4033 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
158 aa  301  2e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4176  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  96.05 
 
 
158 aa  239  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0919098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4149  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  94.29 
 
 
159 aa  228  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0136307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0395  biopolymer transport protein ExbD/TolR  79.26 
 
 
151 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30482  hitchhiker  0.000338676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2097  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.72 
 
 
164 aa  107  4e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0862483  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.39 
 
 
137 aa  81.6  4e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  34.31 
 
 
145 aa  81.6  4e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  36.69 
 
 
139 aa  80.9  6e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  32.08 
 
 
153 aa  80.1  1e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  32.08 
 
 
153 aa  80.1  1e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  34.9 
 
 
139 aa  79.7  1e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 
140 aa  79.3  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 
141 aa  79  2e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.532124  normal  0.142279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  33.58 
 
 
139 aa  78.6  3e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.41 
 
 
154 aa  79  3e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 
138 aa  79  3e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  31.45 
 
 
153 aa  78.6  3e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.96 
 
 
155 aa  78.6  3e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
142 aa  77.8  5e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.11 
 
 
131 aa  77.8  5e-14  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
140 aa  77.8  6e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  39.26 
 
 
143 aa  76.3  1e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
140 aa  76.6  1e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.86 
 
 
143 aa  76.6  1e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
142 aa  76.6  1e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
140 aa  76.3  2e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
140 aa  76.3  2e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
142 aa  76.3  2e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
140 aa  76.3  2e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 
142 aa  74.7  5e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 
142 aa  74.3  6e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
141 aa  73.9  9e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  35.81 
 
 
139 aa  73.6  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
139 aa  73.2  1e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.86 
 
 
142 aa  73.2  1e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.86 
 
 
142 aa  73.2  1e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.86 
 
 
142 aa  73.2  1e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.86 
 
 
142 aa  73.2  1e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.86 
 
 
140 aa  73.6  1e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.86 
 
 
142 aa  73.2  1e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.86 
 
 
142 aa  72.8  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  34.07 
 
 
138 aa  72.4  2e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.32 
 
 
134 aa  72.4  2e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 
143 aa  72.8  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.45 
 
 
138 aa  72.4  2e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 
146 aa  72  3e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 
140 aa  71.6  4e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 
134 aa  71.6  4e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
139 aa  71.6  4e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
143 aa  71.6  4e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  3.95657e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.97 
 
 
144 aa  71.2  5e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
137 aa  71.2  5e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  33.06 
 
 
158 aa  71.2  5e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
134 aa  70.9  6e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  31.76 
 
 
156 aa  70.9  7e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
139 aa  70.9  7e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.85 
 
 
144 aa  70.9  7e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.82 
 
 
139 aa  70.9  7e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.1299e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  33.33 
 
 
155 aa  70.9  7e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
158 aa  70.5  8e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  2.37185e-07 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  33.82 
 
 
138 aa  70.5  9e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  31.82 
 
 
146 aa  70.5  9e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.15 
 
 
143 aa  69.7  1e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.13024e-06 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  33.79 
 
 
167 aa  70.1  1e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 
147 aa  70.1  1e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
143 aa  70.5  1e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.96939e-07  hitchhiker  9.05807e-07 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
141 aa  68.9  2e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  31.94 
 
 
157 aa  69.3  2e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 
147 aa  68.9  2e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.81 
 
 
156 aa  69.3  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
141 aa  69.3  2e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
141 aa  68.9  2e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  31.78 
 
 
143 aa  68.9  3e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  33.11 
 
 
152 aa  68.6  4e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  4.17761e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
141 aa  68.6  4e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  31.34 
 
 
147 aa  68.2  4e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.38 
 
 
148 aa  68.2  4e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
137 aa  67.8  5e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.37129e-08  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.43 
 
 
142 aa  68.2  5e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.27 
 
 
140 aa  67.4  7e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.62 
 
 
140 aa  67.4  7e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 
142 aa  67  9e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.72 
 
 
158 aa  66.6  1e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.82 
 
 
136 aa  66.6  1e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
136 aa  66.6  1e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
136 aa  66.2  2e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  35.21 
 
 
139 aa  65.9  2e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.76 
 
 
176 aa  65.5  2e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
143 aa  65.9  2e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  33.33 
 
 
154 aa  65.9  2e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.76 
 
 
176 aa  65.5  2e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.76 
 
 
176 aa  65.5  2e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  35.88 
 
 
138 aa  65.9  2e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.11 
 
 
141 aa  65.9  2e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.76 
 
 
176 aa  65.5  2e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  30.92 
 
 
140 aa  65.9  2e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.71 
 
 
135 aa  65.9  2e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.76 
 
 
176 aa  65.5  2e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 
133 aa  65.5  3e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>