237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0568 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  100 
 
 
500 aa  1021    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  58.03 
 
 
498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  55.71 
 
 
499 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  55.31 
 
 
507 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  56.54 
 
 
499 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  55.13 
 
 
499 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  54.71 
 
 
500 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  50.4 
 
 
493 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  51.16 
 
 
494 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  48.4 
 
 
499 aa  481  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  48.2 
 
 
496 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  47.19 
 
 
494 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  47.9 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  44.42 
 
 
497 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  48.23 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  45.78 
 
 
487 aa  436  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  47.38 
 
 
490 aa  434  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  45.16 
 
 
502 aa  427  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  44.83 
 
 
508 aa  424  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  46.25 
 
 
522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  44.33 
 
 
496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  44.14 
 
 
516 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  46.55 
 
 
495 aa  402  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  43.11 
 
 
504 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  39.4 
 
 
472 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  42.05 
 
 
473 aa  316  7e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  42.23 
 
 
476 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  42.26 
 
 
463 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  38.8 
 
 
472 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  41.76 
 
 
472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  39.66 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  37.98 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  42 
 
 
471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  38.81 
 
 
465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  40.18 
 
 
463 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  39.33 
 
 
472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  39.96 
 
 
463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  40.87 
 
 
470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  39.96 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  34.99 
 
 
498 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  41.67 
 
 
472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  41.14 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  38.02 
 
 
469 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  39.55 
 
 
468 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  40.18 
 
 
465 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  40.5 
 
 
471 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  38.59 
 
 
461 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  40 
 
 
469 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  39.25 
 
 
469 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  39.47 
 
 
469 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  40.42 
 
 
463 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  38.82 
 
 
469 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  41.8 
 
 
461 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  39.55 
 
 
469 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  35.19 
 
 
487 aa  297  3e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  41.8 
 
 
461 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  38.95 
 
 
477 aa  297  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  38.82 
 
 
469 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  39.77 
 
 
469 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  41.11 
 
 
470 aa  296  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  41.95 
 
 
458 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  38.82 
 
 
469 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  38.82 
 
 
469 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  41.95 
 
 
458 aa  296  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  38.15 
 
 
459 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  34.79 
 
 
491 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  41.34 
 
 
461 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  38.22 
 
 
471 aa  293  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  41.38 
 
 
462 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  39.68 
 
 
462 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  38.64 
 
 
465 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  39.03 
 
 
460 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  37.55 
 
 
470 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  39.19 
 
 
476 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  39.19 
 
 
476 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  37.39 
 
 
473 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  39.72 
 
 
469 aa  289  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  39.72 
 
 
471 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  37.05 
 
 
476 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  40.18 
 
 
467 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  39.16 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  39.72 
 
 
462 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  37.77 
 
 
475 aa  286  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  39.23 
 
 
448 aa  285  9e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  34.36 
 
 
580 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  37.73 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  36.67 
 
 
473 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  35.75 
 
 
487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  34.48 
 
 
476 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  37.96 
 
 
466 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  36.59 
 
 
460 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  37.39 
 
 
481 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  34.79 
 
 
490 aa  279  7e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  37.45 
 
 
471 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  37.73 
 
 
470 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  38.41 
 
 
461 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  36.36 
 
 
461 aa  277  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  36.94 
 
 
547 aa  277  4e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  37.05 
 
 
470 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  37.82 
 
 
475 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>