187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0145 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  44.11 
 
 
316 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  43.52 
 
 
358 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  42.76 
 
 
312 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  41.24 
 
 
305 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  41.45 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  43.62 
 
 
314 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  43.14 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  42.62 
 
 
316 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  40.07 
 
 
307 aa  188  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  40.78 
 
 
300 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  42.4 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.26 
 
 
297 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  32.98 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  33.7 
 
 
319 aa  125  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  33.7 
 
 
293 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  31.32 
 
 
286 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
283 aa  115  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  31.82 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.81 
 
 
296 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.64 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  34.16 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  30.08 
 
 
303 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  28.32 
 
 
301 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  31.91 
 
 
294 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 
301 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  34.21 
 
 
323 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  29.79 
 
 
302 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 
301 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  30.47 
 
 
303 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  32.99 
 
 
310 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  30.47 
 
 
303 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  30.47 
 
 
303 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  30.08 
 
 
301 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  28.57 
 
 
301 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  31.56 
 
 
292 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  35.56 
 
 
297 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  30.47 
 
 
303 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  30.47 
 
 
303 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  30.47 
 
 
303 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  30.47 
 
 
303 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  32.48 
 
 
294 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 
296 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  30.24 
 
 
336 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  28.68 
 
 
277 aa  99.4  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 
343 aa  99  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 
289 aa  99  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
290 aa  95.9  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  31.52 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  31.56 
 
 
305 aa  92.8  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  29.09 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 
294 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  30.28 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.84 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  28.52 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
308 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  30.8 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  30.8 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  30.8 
 
 
323 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  30.8 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  30.8 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  30.8 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  30.8 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  29.58 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  27.48 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  29.07 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  29.07 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  32.3 
 
 
317 aa  85.9  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.13 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  32.46 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  32.09 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  30.43 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  29.45 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2982  DMT family permease  32.87 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  30.82 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  29.26 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  31 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  31 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  28.67 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  31.34 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  32.39 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  29.35 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  27.21 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  28.73 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  29.27 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  27.05 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  26.83 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>